Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

MHC – Centrum av Hästens Immunsystem

Status: Avslutat
Projektnummer: H1147283
Kategori: Forskningsprogram | Häst
Ansökningsår: 2011
Datum för slutrapport: 1 juli 2016
Huvudsökande: Tomas Bergström
Organisation: Sveriges lantbruksuniversitet, SLU
E-postadress: tomas.bergstrom@slu.se
Telefon: 018671997
Beviljade medel: 1 600 000 SEK

MHC-regionen kännetecknas av ett stort antal polymorfa gener med viktiga funktioner i immunsystemet . Den höga graden av variation i MHC-regionen gör sekvensering extremt svårt men skulle kunna lösas genom nya sekvenseringstekniker, s.k. ”next generation sequencing ” (NGS). Resultaten visade att NGS-plattformar som ger korta sekvenser (reads) på 150 bp, kan användas för att fånga upp variation i MHC-regionen men däremot kan de korta sekvenserna inte användas för att konstruera en tillförlitlig referenssekvens. För att lösa detta problem använde vi PacBio-sekvensering av BAC-kloner. Detta resulterade i en 1,2 Mbp sekvens av hästens MHC klass Il. Genannoteringen identifierade mer än 30 gener. En jämförande analys av strukturen visade att hästen MHC klass II är annorlunda organiserad än det mänskliga MHC. Den högkvalitativa referenssekvensen kommer att vara betydelsefull för associationsstudier av immunmedierade sjukdomar och därmed ett viktigt bidrag till fortsatta studier.

Vi människor uppvisar både stora likheter och skillnader med andra däggdjur. Det gäller oavsett om vi jämför oss med en häst, varg, blåval, grävling, känguru eller något annat djur. Hästar precis som människor drabbas ibland av ärftliga sjukdomar. En del av dessa sjukdomar beror på enstaka mutationer i enskilda gener och är relativt ovanliga. Andra ärftliga sjukdomar orsakas av en kombination av både miljöfaktorer och flera olika gener. De är betydligt vanligare och brukar ofta kallas för komplexa sjukdomar. Det finns många exempel på komplexa sjukdomar, bland annat folksjukdomar så som olika former av cancer, hjärt-kärl sjukdomar, allergier och andra sjukdomar som har med immunsystemet att göra. Hos alla däggdjur inklusive hästen finns region i arvsmassan som kallas Major histocompatibilty complex (MHC) där det finns ett stort antal gener viktiga funktioner i immunsystemet. I många av sjukdomsstudier hos häst har det visats att MHC regionen har stor betydelse. Regionen innehåller inte bara ett stort antal gener. Många gener förekommer också i duplicerade kopior där varje gen uppvisar en stor variation mellan individer. Eftersom MHC regionen har varit dåligt kartlagt har det varit svårt att dra riktiga slutsatser om vilka eller vilka gener som ger öka eller minskad risk för en sjukdom. Exempel på sådana sjukdomar hos häst är till exempel sarkoider (inkar), luftvägsproblem, sommareksem och många andra immunorelaterade sjukdomar. I det här projektet har vi därför använd avancerad sekvenseringsteknik för att producera en högkvalitativ referenssekvens över en del av hästens MHC-region och sedan noggrant analyserat var varje enskild gen ligger. Som ett resultat av denna studie är det nu möjligt att ta reda på vilka MHC gener som har betydelse för en rad sjukdomar där MHC spelar en avgörande roll. Resultaten kan därför bidra till att förbättrad hästhälsa och genom att öka kunskapen om ärftliga riskfaktorer.

 

Antal träffar i projektbanken: 1528

Betstämning av rotdjup i spannmålsgrödor med kvantitativ PCR- teknik.
Ulf Axelson, Hushållningssällskapet Skaraborg

Projektnummer: H1333238 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 29 september 2016

In studies of root development in crops has so far the most common method included technics with washing soil from the roots. The aim of this project is to test a method based on quantitative PCR technique to describe root development with respect to rooting depth and root mass and also compare …

Läs mer

Peptider och proteiner – bekämpning av nya missbrukspreparat inom hästsporten
Mikael Hedeland, Statens Veterinärmedicinska Anstalt

Projektnummer: H1347097 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 29 september 2016

The abuse of peptide- and protein-based substances has emerged as a new problem in horse racing. Examples are cobratoxin and dermorphin for pain relief, erythropoietin (EPO) for enhanced oxygen transport, and growth stimulating peptides of different kind. The use of this type of substances creates …

Läs mer

Mjölkkornas välbefinnande i automatiska mjölkningssystem
Hans Wiktorsson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: 0130020 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 23 september 2016

Sammanfattning saknas

Läs mer

TALA SMAK- Matfågel 2015
Lotta Waldenstedt, Svensk Fågel Service AB

Projektnummer: R-15-43-375 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 9 september 2016

Flavour Speak Poultry 2015 ' is part of the mainproject Tala Smak (TS) that provides a basis for a cross-border gastronomic language. The overall purpose is to validate and refine the methodology for describing food, which means that more people can understand, appreciate, and talk about the food …

Läs mer

Kamp mot tramp
Eva Spörndly, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1230034 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 september 2016

The objective of the first part of the project is to compare four leys with regard to the speed of establishment and the capacity to withstand trampling. In the second part of the project three methods to protect areas especially exposed to trampling will be evaluated. In the first part, new seeds …

Läs mer

Hur används biogas bäst?
Åke Nordberg, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1140116 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 31 augusti 2016

Biogas kan uppgraderas och komprimeras till fordonsbränsle (CBG), men låg energitäthet och begränsad gasinfrastruktur försvårar distribution, lagring och marknadstillgänglighet. I projektet har potentiella tekniker för att framställa flytande drivmedel (flytande biogas (LBG), Fisher Tropsch Diesel, …

Läs mer

Bedömning av risken för frostskador i höstvete utifrån sorters frosttolerans med hjälp av en simuleringsmodell och fältförsöksdata
Henrik Eckersten, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1233151 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 30 augusti 2016

Winter kill due to low temperatures causes significant losses in winter wheat. The variety specific winter hardiness in winter wheat depends on developmental stage and environmental factors. In field, winter hardiness is assessed by the percentage of surviving plants in spring. Winter-hardiness is …

Läs mer

Integrerat växtskydd- vad kan vi lära av 20 års integrerad växtodling?
Maria Stenberg, Hushållningssällskapet Skaraborg

Projektnummer: V1160064 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 25 augusti 2016

Omkring år 1990 var det stora förändringar i jordbrukspolitiken och miljökraven ökade. Stor överproduktion pressade priserna på produkterna. Det var svårt att få ekonomi i odlingen. Samtidigt utvecklades tankar på nya odlingssystem. Vid denna tid startades ett Europeiskt samarbetsprojekt där man …

Läs mer

Utveckling av integrerade bekämpningstrategier i växthusgurka i samverkan med odlare
Birgitta Rämert, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1256026 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 18 augusti 2016

The project will, in collaboration with farmers, extension officers and researchers, develop integrated pest management strategies against powdery mildew in greenhouse production of cucumber. Microbiological pest control products permitted in the EU and/or other parts of the world as well as other …

Läs mer

Biologisk Markkartering- Integrerad analys av jordburna växtsjukdomar och markkemi i oljeväxter och stråsäd- FAS II
Anders Jonsson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1133275 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 2 augusti 2016

I SLU TEMA-forskningsprogrammet ”Biologisk markkartering av jordburna patogener (BioSoM)” har utvecklats DNA-baserade detektionsmetoder. Specifika DNA-sekvenser och qPCR-teknik används för kvantifiering av växtpatogener i jord. Det gäller detektion och kvantifiering av ärtrotröta (Aphanomyces …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress