Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Ny metod för virulensbestämning av fotrötebakterier hos får

Status: Avslutat
Projektnummer: H1350161
Kategori: Forskningsprogram | Kött
Ansökningsår: 2013
Datum för slutrapport: 25 juni 2015
Huvudsökande: Erik Eriksson
Organisation: Statens Veterinärmedicinska Anstalt
E-postadress: erik.eriksson@sva.se
Telefon: ?
Medsökande: Sara Frosth
Medsökande: Ulrika König
Beviljade medel: 995 000 SEK

Virulent footrot causes extensive damage to the feet of affected sheep and leads both to animal suffering and economic losses. In the UK, footrot is estimated to cost the industry £24 million annually. In the current situation there is no method for virulence determination of the footrot pathogen Dichelobacter nodosus available in Sweden. Outbreak of virulent footrot risk becoming more common in Swedish sheep in the future because of EU rules on free trade with animals, climate change and reduced funding to the footrot control program. The goal of this project is to develop a test that quickly and cost-effectively can identify potential sheep flocks carrying virulent strains of D. nodosus and can be used as a diagnostic tool in the ongoing control program against footrot. The test would be especially valuable in the control program to ensure that virulent footrot is not present in sheep flocks where the clinic is uncertain.

Virulent fotröta ger upphov till mycket omfattande skador på klövarna hos drabbade får och orsakar både djurlidande och stora ekonomiska förluster. I Storbritannien beräknas fotröta ge ett ekonomiskt bortfall på 24 miljoner pund årligen. I dagsläget finns ingen metod för virulensbestämning av fotrötebakterien Dichelobacter nodosus tillgänglig i Sverige. Utbrott av virulent fotröta riskerar att bli vanligare hos svenska får i framtiden på grund av EU-regler för frihandel med djur, klimatförändringar och minskade anslag till kontrollprogrammet. Målet med detta projekt är att ta fram ett test som snabbt och kostnadseffektivt kan identifiera eventuella fårbesättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta. Testet skulle bli speciellt värdefullt i kontrollprogrammet för att säkerställa att det inte rör sig om virulent fotröta i besättningar där kliniken är osäker.

Fotröta är en smittsam klövsjukdom hos får som orsakas av bakterien D. nodosus. Sjukdomen kan uppträda med varierande svårighetsgrad som till stor del beror på virulensegenskaper hos den infekterande bakteriestammen. En metod för virulensbestämning av D. nodosus har inte tidigare funnits tillgänglig i Sverige. Syftet med projektet var att utveckla ett test som kan identifiera eventuella besättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta. En real-tids PCR baserad på en känd virulensgen hos D. nodosus utvecklades som var känslig, specifik och gick snabbt att utföra. Metoden krävde dessutom inte att bakterien odlades fram innan analys. Ett annat mål var att utvärdera om flera prover kunde analyseras tillsammans på en och samma gång dvs. poolas för att minska framtida analyskostnader. Denna studie visade att prover kunde poolas fem och fem innan analys med bibehållen känslighet.

Bakgrund och syfte
Fotröta är en smittsam klövsjukdom hos får som orsakas av bakterien Dichelobacter nodosus. Sjukdomen förekommer i de flesta lammproducerande länder och ger upphov till både djurlidande och ekonomiska förluster. Fotröta kan uppträda med varierande svårighetsgrad som till stor del beror på virulensegenskaper hos den infekterande bakteriestammen. En snabb och säker metod för virulensbestämning av D. nodosus har inte tidigare funnits tillgänglig i Sverige. Målet med projektet var att ta fram ett test som snabbt och kostnadseffektivt kan identifiera eventuella besättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta (Klövkontrollen).

Resultat
Ett test för virulensbestämning av D. nodosus som kunde påvisa samt skilja mellan benigna (godartade) respektive virulenta (aggressiva) stammar utvecklades i detta projekt. Testet krävde inte att bakterien odlades fram innan analys utan kunde användas direkt på kliniska prover såsom svabbar och biopsier. Det framtagna testet hade hög specificitet, känslighet och gick snabbt att utföra. Det var även möjligt att analysera prover från fem olika djur tillsammans på en och samma gång (poolning) med fortsatt god känslighet. Testet hade god känslighet vid jämförelse med ett liknande test och gick något snabbare att utföra.

Metod
Ett test för virulensbestämning av D. nodosus i form av en real-tids PCR (Polymerase Chain Reaction) designades med hjälp av en mjukvara avsedd för ändamålet (Primer Express). För att utvärdera det framtagna testet användes både referensstammar från olika bakteriearter inklusive D. nodosus såväl som kliniska prover. För att undersöka om flera prover kunde analyseras tillsammans på en och samma gång dvs. poolas togs 250 nya prover från 19 fårbesättningar som dels analyserades individuellt och dels poolades fem och fem. Det ny framtagna testet jämfördes även med ett liknande test som publicerats under projektets gång med avseende på bland annat känslighet och snabbhet.

 

Antal träffar i projektbanken: 1555

Billiga jordanalyser oavsett gårdsstorlek med en nationell NIR-databas
Johanna Wetterlind, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1333187 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

The overall aim with the project is to make good predictions of within-field soil variation to a reasonable cost regardless of farm size. This will be done by constructing a national database with 5000 soils analyzed with near infrared reflectance (NIR) spectroscopy. Such a large database, covering …

Läs mer

MHC – Centrum av Hästens Immunsystem
Tomas Bergström, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1147283 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

MHC-regionen kännetecknas av ett stort antal polymorfa gener med viktiga funktioner i immunsystemet . Den höga graden av variation i MHC-regionen gör sekvensering extremt svårt men skulle kunna lösas genom nya sekvenseringstekniker, s.k. ”next generation sequencing ” (NGS). Resultaten visade att …

Läs mer

Genetisk bakgrund till prestationsegenskaper hos svenskt varmblod (SWB)
Sofia Mikko, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1147215 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

Treåriga svenska varmblood (SWB)-hästar har traditionellt bedömts på en tiogradig skala men under 2013 infördes istället linjärbedömning. Hästarna bedöms för egenskaper som exteriör, gångarter och hoppförmåga. Denna studie syftade till att hitta genomregioner i kopplade till dessa egenskaper. …

Läs mer

Tjänster och gentjänster - hur kan ekosystemtjänster inkluderas i jordbruksföretagens hållbarhetsarbete?
Christel Cederberg, SIK, Institutet för Livsmedel och bioteknik

Projektnummer: H1346123 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 29 juni 2016

Farmers and food industry need methods for quantifying and valuating ecosystem services that are connected to agricultural production. The purpose of this project is to test and develop methods for quantifying important ecosystem services to achieve a broader picture of the values of agricultural …

Läs mer

Samband mellan groddbränna och frilevande nematoder
Maria Viketoft, SLU

Projektnummer: H1142045 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 27 juni 2016

Interaktionen mellan potatisplanta, svampen Rhizoctonia solani och frilevande växtätande nematoder undersöktes i en serie krukförsök i syfte att identifiera interaktionen och förstå orsakssambanden för dålig uppkomst. Potatisplantorna fick tydliga skador av båda organismerna och tillväxten …

Läs mer

Vilken effekt har fånggrödor, skörderester, mineral- och stallgödsel på skördepotential och mullförråd i marken?
Thomas Kätterer, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: H1233013 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 22 juni 2016

The effect of catch crops, management of crop residues, mineral fertilizers and manure on crop production, soil fertility and soil carbon stocks over time will be quantified. This assessment will improve the tools used in agricultural extension work, as well as in lifecycle analysis and greenhouse …

Läs mer

Biovärdering - Är biologiska bekämpningsmedel från utländska marknader användbara som alternativa bekämpningsmetoder mot växtsjukdomar i Sverige?
Margareta Hökeberg, Svenska Lantmännen

Projektnummer: V1133033 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 17 juni 2016

Svensk växtodling har idag få bekämpningsmedel mot flera allvarliga växtsjukdomar. Tillgången har minskat bl a genom att flera produkter fasats ut i och med de skärpta reglerna i EUs växtskyddsmedelsförordning. Vi ville därför undersöka om biologiska bekämpningsprodukter som finns på marknaden i …

Läs mer

Biovärdering - är biologiska bekämpningsmedel från utländska marknader användbara mot svenska växtsjukdomar?
Margareta Hökeberg, Svenska Lantmännen

Projektnummer: H0956299 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 17 juni 2016

Svensk trädgårdsodling har idag få bekämpningsmedel mot flera allvarliga växtsjukdomar, delvis pga av en begränsad inhemsk marknad. Tillgången har minskat bl a genom att flera produkter fasats ut i och med de skärpta reglerna i EUs växtskyddsmedelsförordning. Vi ville därför undersöka om biologiska …

Läs mer

Risk för härsken smak i mjölk ökar - kan vigöra något åt det?
Mikko Griinari, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: V1130059 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 13 juni 2016

Syftet med projektet var att undersöka effekten av att byta ur palmolja i kraftfoder till mjölkkor mot rapsolja på mjölkens benägenhet att utveckla härsken smak vid olika mjölkningsfrekvens. Detta undersöktes i två utfodringsförsök där mjölkens fettsyrasammansättning, halten av fria fettsyror i …

Läs mer

Inverkan av stallgödsel och rajgräsfånggröda på betcystnematoden
Ann-Charlotte Wallenhammar, HS Konsult AB

Projektnummer: H1144237 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 4 juni 2016

Stallgödselns effekt på betcystnematoden (BCN) mättes i tre fältförsök och ett krukförsök sådda med vårvete. Försöken behandlades med svinflyt, nötflyt resp. NPK-gödsel före sådd. Jordprover togs ut och populationstäthet av BCN analyserades för varje behandling på våren, före sådd och …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress