Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Ny metod för virulensbestämning av fotrötebakterier hos får

Status: Avslutat
Projektnummer: H1350161
Kategori: Forskningsprogram | Kött
Ansökningsår: 2013
Datum för slutrapport: 25 juni 2015
Huvudsökande: Erik Eriksson
Organisation: Statens Veterinärmedicinska Anstalt
E-postadress: erik.eriksson@sva.se
Telefon: ?
Medsökande: Sara Frosth
Medsökande: Ulrika König
Beviljade medel: 995 000 SEK

Virulent footrot causes extensive damage to the feet of affected sheep and leads both to animal suffering and economic losses. In the UK, footrot is estimated to cost the industry £24 million annually. In the current situation there is no method for virulence determination of the footrot pathogen Dichelobacter nodosus available in Sweden. Outbreak of virulent footrot risk becoming more common in Swedish sheep in the future because of EU rules on free trade with animals, climate change and reduced funding to the footrot control program. The goal of this project is to develop a test that quickly and cost-effectively can identify potential sheep flocks carrying virulent strains of D. nodosus and can be used as a diagnostic tool in the ongoing control program against footrot. The test would be especially valuable in the control program to ensure that virulent footrot is not present in sheep flocks where the clinic is uncertain.

Virulent fotröta ger upphov till mycket omfattande skador på klövarna hos drabbade får och orsakar både djurlidande och stora ekonomiska förluster. I Storbritannien beräknas fotröta ge ett ekonomiskt bortfall på 24 miljoner pund årligen. I dagsläget finns ingen metod för virulensbestämning av fotrötebakterien Dichelobacter nodosus tillgänglig i Sverige. Utbrott av virulent fotröta riskerar att bli vanligare hos svenska får i framtiden på grund av EU-regler för frihandel med djur, klimatförändringar och minskade anslag till kontrollprogrammet. Målet med detta projekt är att ta fram ett test som snabbt och kostnadseffektivt kan identifiera eventuella fårbesättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta. Testet skulle bli speciellt värdefullt i kontrollprogrammet för att säkerställa att det inte rör sig om virulent fotröta i besättningar där kliniken är osäker.

Fotröta är en smittsam klövsjukdom hos får som orsakas av bakterien D. nodosus. Sjukdomen kan uppträda med varierande svårighetsgrad som till stor del beror på virulensegenskaper hos den infekterande bakteriestammen. En metod för virulensbestämning av D. nodosus har inte tidigare funnits tillgänglig i Sverige. Syftet med projektet var att utveckla ett test som kan identifiera eventuella besättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta. En real-tids PCR baserad på en känd virulensgen hos D. nodosus utvecklades som var känslig, specifik och gick snabbt att utföra. Metoden krävde dessutom inte att bakterien odlades fram innan analys. Ett annat mål var att utvärdera om flera prover kunde analyseras tillsammans på en och samma gång dvs. poolas för att minska framtida analyskostnader. Denna studie visade att prover kunde poolas fem och fem innan analys med bibehållen känslighet.

Bakgrund och syfte
Fotröta är en smittsam klövsjukdom hos får som orsakas av bakterien Dichelobacter nodosus. Sjukdomen förekommer i de flesta lammproducerande länder och ger upphov till både djurlidande och ekonomiska förluster. Fotröta kan uppträda med varierande svårighetsgrad som till stor del beror på virulensegenskaper hos den infekterande bakteriestammen. En snabb och säker metod för virulensbestämning av D. nodosus har inte tidigare funnits tillgänglig i Sverige. Målet med projektet var att ta fram ett test som snabbt och kostnadseffektivt kan identifiera eventuella besättningar som bär på virulenta stammar av D. nodosus och som kan användas som ett diagnostiskt redskap i det pågående kontrollprogrammet mot fotröta (Klövkontrollen).

Resultat
Ett test för virulensbestämning av D. nodosus som kunde påvisa samt skilja mellan benigna (godartade) respektive virulenta (aggressiva) stammar utvecklades i detta projekt. Testet krävde inte att bakterien odlades fram innan analys utan kunde användas direkt på kliniska prover såsom svabbar och biopsier. Det framtagna testet hade hög specificitet, känslighet och gick snabbt att utföra. Det var även möjligt att analysera prover från fem olika djur tillsammans på en och samma gång (poolning) med fortsatt god känslighet. Testet hade god känslighet vid jämförelse med ett liknande test och gick något snabbare att utföra.

Metod
Ett test för virulensbestämning av D. nodosus i form av en real-tids PCR (Polymerase Chain Reaction) designades med hjälp av en mjukvara avsedd för ändamålet (Primer Express). För att utvärdera det framtagna testet användes både referensstammar från olika bakteriearter inklusive D. nodosus såväl som kliniska prover. För att undersöka om flera prover kunde analyseras tillsammans på en och samma gång dvs. poolas togs 250 nya prover från 19 fårbesättningar som dels analyserades individuellt och dels poolades fem och fem. Det ny framtagna testet jämfördes även med ett liknande test som publicerats under projektets gång med avseende på bland annat känslighet och snabbhet.

 

Antal träffar i projektbanken: 1528

Biologisk Markkartering- Integrerad analys av jordburna växtsjukdomar och markkemi i oljeväxter och stråsäd- FAS II
Anders Jonsson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1133275 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 2 augusti 2016

I SLU TEMA-forskningsprogrammet ”Biologisk markkartering av jordburna patogener (BioSoM)” har utvecklats DNA-baserade detektionsmetoder. Specifika DNA-sekvenser och qPCR-teknik används för kvantifiering av växtpatogener i jord. Det gäller detektion och kvantifiering av ärtrotröta (Aphanomyces …

Läs mer

Proteinvärdering med vätesulfid
Torsten Eriksson, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1330052 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 7 juli 2016

Improvements in nitrogen efficiency in ruminants are needed. Correct feed evaluation is a prerequisite and protein degradation in the rumen is one of the most important factors to consider. This project aims at developing a routine assay for protein degradation in ruminant feeds, where gaseous …

Läs mer

Framtagning av bladmögelresistenta matpotatissorter för hela Sverige
Ulrika Carlson-Nilsson, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: H1342236 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 6 juli 2016

The project goal is to develop commercially interesting potato cultivars for the whole of Sweden as a combination project together with the excisting plant breeding program at SLU Alnarp. Focus is to develop cultivars with sustainable resistance to late blight and brown rot caused by Phytophthora …

Läs mer

Hur påverkas slaktvikt och skinnkvalitet hos lamm av övernattning på slakteriet?
Katarina Arvidsson, SLU

Projektnummer: H1350229 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 6 juli 2016

An increasing proportion of animals are staying overnight at abattoirs before slaughter. Some studies conclude that lairage after transport allows the animal to rest, regenerate body reserves and reduce the degree of dehydration, while others believe that the lairage environment itself may inhibit …

Läs mer

Biologi och teknik för förbättrad markanvändning i potatisodling - Aktörsamverkan för hållbar kunskapsutveckling
Paula Persson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1042201 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 4 juli 2016

Sammanfattning av forskningsprojektet (svenska)
Syftet är att utveckla en långsiktigt fungerande plattform för aktörssamverkan kring potatisforskning mellan
forskare, rådgivare, lantbrukare och andra intressenter. Målet är att gemensamt utveckla en modell för hållbar
kunskap kring effektiv, lönsam …

Läs mer

Biologi och Teknik för förbättrad markanvändning i potatisodling - Aktörsamverkan för hållbar kunskapsutveckling, BoT-A, år 4
Paula Persson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1342225 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 4 juli 2016

The objective is to develop a long-term platform serving as cooperative participation concerning potato research
between scientists, advisors, farmers and industry. The aim is to jointly develop a model for sustainable knowledge
round efficient, profitable and competitive production. Traditional …

Läs mer

Ensilering av grovfoder. Del II - Stoppa varmgången
Rolf Spörndly, SLU

Projektnummer: V1330016 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

Spontaneous heating in the silage at opening the silos is the most common problem in feed storage systems at Swedish dairy farms. Large volumes of feed are discarded causing economical loss and feeds in the process of deterioration are a risk to animal health. Yeast is identified as the most …

Läs mer

Fodereffektiva kor
Pekka Huhtanen, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1230028 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

This project represents SLU´s contribution to a Nordic initiative for improved feed efficiency (FE) in dairy production and reduced environmental impact. The concept FE represents how effective nutrients are transformed to animal products. FE has been used a benchmark within poultry, swine and beef …

Läs mer

Billiga jordanalyser oavsett gårdsstorlek med en nationell NIR-databas
Johanna Wetterlind, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1333187 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

The overall aim with the project is to make good predictions of within-field soil variation to a reasonable cost regardless of farm size. This will be done by constructing a national database with 5000 soils analyzed with near infrared reflectance (NIR) spectroscopy. Such a large database, covering …

Läs mer

MHC – Centrum av Hästens Immunsystem
Tomas Bergström, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1147283 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 1 juli 2016

MHC-regionen kännetecknas av ett stort antal polymorfa gener med viktiga funktioner i immunsystemet . Den höga graden av variation i MHC-regionen gör sekvensering extremt svårt men skulle kunna lösas genom nya sekvenseringstekniker, s.k. ”next generation sequencing ” (NGS). Resultaten visade att …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress