Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse
finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Utveckling av beslutsstöd för riskbedömning av Sclerotinia sclerotiorum i vårraps genom kvantifiering av luftburen smitta och studier av infektionsprocessen

Status: Avslutat
Projektnummer: H0960195
Kategori: Forskningsprogram | Fältförsök & metodutveckling
Ansökningsår: 2009
Datum för slutrapport: 3 november 2014
Huvudsökande: Ann-Charlotte Wallenhammar
Organisation: HS Konsult AB
E-postadress: ac.wallenhammar@hush.se
Telefon: 019 - 603 27 00
Beviljade medel: 740 000 SEK

Bomullsmögel som orsakas av Sclerotinia sclerotiorum, överlever med vilkroppar i jorden. S.sclerotiorum- DNA bestämdes med realtids PCR på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk i två fältförsök 2010. DNA påvisades på samtliga bladnivåer vid första provtagningen, och andel blad med DNA var statistiskt signifikant större för lägst sittande blad. Frånvaron av DNA på kronbladen i ett av försöken visar att den gängse uppfattningen om kronbladens betydelse för infektion måste omvärderas. Analyser av luftprover visade att sporspridningen avtagit innan blomningen. Test av verktygen i tio praktiska odlingar 2011 visade S.sclerotiorum DNA i samtliga fält, företrädesvis på lägst sittande blad vid andra provtagningen. Jordanalyserna, de första i sitt slag, visar förekomst i 55 % av fälten där odlingsuppehållet i de flesta fall överstiger tio år vilket är ett banbrytande upptäckt. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras.

Nya DNA-baserade verktyg banbrytande för riskbedömning av bomullsmögel i vårraps
Resultat
Svamp- DNA fanns på stjälkens blad vid första provtagningen i fältförsöken. Andelen blad med DNA ökade ju längre ner i beståndet bladen satt, och skillnaden mellan översta och lägst sittande blad var statistisk säkerställd. DNA påvisades inte på kronbladen vid någon av provtagningarna i ett av försöken, medan svampen samtidigt fanns på bladen. Analyserna av luftproven visar att sporspridningen hade upphört när blomningen började, och detta samband är banbrytande då infekterade kronblad tidigare ansetts vara källan till infektion. Test av verktygen i tio praktiska odlingar med stor variation i såtidpunkt visade att svamp- DNA fanns i samtliga fält, företrädesvis på lågt sittande blad vid andra provtagningen. Analyserna av luftproven 2011 visar att sporspridningen startade efter första provtagningen och sammanföll väl med andra provtagningen. Trots att odlingsuppehållet till föregående rapsgröda var mer än tio år, påvisade vi svamp- DNA på bladen i samtliga fält. Jordanalyserna, som är de första vi känner till, visade att spår av svampens vilkroppar fanns i 55 % av fälten.
Metod
Vi har bestämt svampens DNA med realtids-PCR teknik på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk. Två fältförsök anlades 2010 i befintliga odlingar av SW Joplin i Örebro län. Blad från plantans stjälk och kronblad samlades in var 5:e dag, med början den 21 juni, strax före blomning, och avslutades den 14 juli. Proverna förpackades och förvarades i frys. Sporfällan, Burkhard 7-day Spore trap, placerades i fält 25 maj - 1 augusti 2010 och 24 maj- 25 juli 2011, för att fånga in avgörande händelser. Tejpen byttes veckovis och klipptes i delar motsvarande dygnsfångster, innan de preparerades för molekylär diagnostik. Utvärdering av metoderna gjordes i tio fält 2011 då två provtagningar gjordes, den första i tidig blomning och den andra en vecka senare. Kronblad, de översta och lägst sittande bladen från tio plantor analyserades. I varje testyta togs jordprov för DNA- analys, och angreppet i beståndet bestämdes.
Slutsats och råd till näringen
Oljeväxtodlingen ökar, framförallt på gårdar där raps odlas regelbundet. Ökad frekvens av oljeväxter i växtföljden ökar risk för angrepp av bomullsmögel, en svamp som överlever med vilkroppar i jorden . Beslut om fungicidbehandling måste tas innan symtomen är synliga, och kräver att odlaren gör en aktiv riskbedömning.
Vi presenterar banbrytande verktyg för riskbedömning baserade på analys av svamp- DNA. Dessa metoder ger oss ny information om t ex svampar som tidigare inte kunde identifieras visuellt med mikroskop eller med agarplattor. Riskbedömning baserad på analys av svampens DNA på de lägst sittande bladen är ett effektivt verktyg för att lokalisera fältsmitta. Hur stort angreppet blir beror ytterst på väderleken, framförallt luftfuktigheten i beståndet, under blomningen. Analys av luftprover ger oss information som tydligt visar när sporspridningen startar på en bestämd lokal, och vi har sett att denna tidpunkt varierar mellan år. Sporfällor är ett effektivt verktyg som inte använts tidigare som vi anser har stor potential, och bör utvecklas vidare.
Vi har också visat att blommans kronblad, som tidigare varit huvudspåret när olika metoder testats, framstår som en osäker väg. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras. Fältbaserade tester har en stor potential, och fortsatt utveckling av nya s k isotermiska DNA-baserade metoder kan förenkla analysproceduren ytterligare. Utveckling av sporfällor och optimering av tekniken så att analyser dagligen kan sändas som textmeddelanden tillsammans med lokala väderprognoser kommer att vara hörnpelare i en aktiv prognosmodell.
Sammantaget ger våra nya resultat en stor affärsnytta för lantbrukaren, då en fältbaserad analys ger svar på om svampen finns i beståndet, och en behovsanpassad fungicidbehandling minskar avtrycken i miljön.

 

Antal träffar i projektbanken: 1524

Ridundervisningens pedagogiska praktik; lärande, interaktion och kommunikation om ryttarkänsla
Anna Bergh, SLU

Projektnummer: H-15-47-054 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2015

The aim of the project is to study how instructors at Swedish riding schools instruct and communicate "the riding feeling". The focus is on communication, pupil´s learning and the interaction between instructor, pupil and horse. The "riding feeling" is a tacit knowledge and refers to the rider’s …

Läs mer

Ökad lönsamhet med nya avelsverktyg i mjölkkobesättningarna
Anna Näsholm, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: V1330025 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

The aim is to study the possibility to improve profitability on herd level in Swedish milk production by using sexed semen and genotyping heifers in the dairy herds and combine this with planned crossbreeding and use of beef semen. For this purpose we will estimate genetic progress and do economic …

Läs mer

Golvunderlagets inverkan på kornas gång
Hans von Wachenfelt, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1430018 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2014

A primary reason for unhealthy legs and claws are unsuitable floor properties in dairy houses,
which may result in slippery floors and slip injuries to cows and mastitis.
The hygiene of a floor surface and floor properties affect the cow claw/floor interaction and gait.
The aim is to determine an …

Läs mer

Kartläggning av prestationsegenskaper, genetisk variation och hälsa hos kallblodstravaren
Gabriella Lindgren, Sveriges Lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H-15-47-075 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2015

This SLU - NMBU collaborative study seeks to improve the performance, health and welfare of the Norwegian/ Swedish Coldblooded trotter. Experts in Equine clinical veterinary medicine, performance evaluation and genetic testing will analyze the genome of this horse breed for: 1) race performance …

Läs mer

Riskfaktorer för sjuklighet hos kalvar i den specialiserade köttproduktionen samt möjligheter till profylax.
Stefan Alenius, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1350026 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

Pneumonia is the most prevalent disease in Swedish feedlot cattle herds, causing mortality as well as affecting weight gain, rearing time and economy. Viral infections, including bovine respiratory syncytial virus (BRSV) and bovine coronavirus (BCV) as major actors, cause respiratory disease. …

Läs mer

Smågrisdödlighet- en parallell jämförelse mellan två boxsystem i kombination med optimala skötselrutiner
Anne-Charlotte Olsson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: V1450008 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2014

Piglet mortality in Swedish pig herds is too high and if the sow should be completely loose or fixed a short time in connection with farrowing, is an important issue.
However, to perform internationally publishable studies of piglet mortality, parallel studies in the same herd, are required. These …

Läs mer

Underlag för nya kaliumrekommendationer till svensk potatisproduktion
Helene Larsson Jönsson, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1342093 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

The aim of this research proposal is to support well-founded potassium recommendations for Swedish table potatoes. The main issue today is that the recommendations are based on a few old experiments which were carried out with old management practices. There is a general practice among Swedish …

Läs mer

Inverkan av såtidpunkt och utsädesmängd på avkastningen hos aktuella typsorter av höstvete
Jannie Hagman, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1333056 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

Winter wheat harvests shows large variations over the years, and for the optimal plant population in the spring sowing time, stand establishment and winter survival is crucial. We want to examine the relation between sowing time, seed rate and temperature, and how it affects winter wheat crop …

Läs mer

Kassationer vid slakt i svensk slaktkycklingproduktion - finns möjliga vägar till förbättringar?
Helena Wall, Sveriges lantbruksuniversitet

Projektnummer: R-15-43-372 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2015

Swedish meat-type chicken production is successful as regards maintaining a high production standard
with a very low use of antibiotics and an overall good health status. However, despite this, concerns are
raised among people in the sector regarding that condemnations at slaughter seem to be at …

Läs mer

Hästens och människans välfärd och värdighet
Henrik Lerner, Ersta Sköndal högskola

Projektnummer: H-16-47-177 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2016

The aim of our project is to develop an ethical evaluation tool for Equine Assisted Therapy that considers the welfare and the dignity of both horse and human. This tool will facilitate the evaluation of a practice giving information on the good life of both the horse and the human. If the practice …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress