Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Jämförelse mellan okulär gradering och PCR-teknik för att bestämma angrepp av växtpatogener i höstvete.

Status: Avslutat
Projektnummer: H1060230
Kategori: Forskningsprogram | Fältförsök & metodutveckling
Ansökningsår: 2010
Datum för slutrapport: 16 juli 2012
Huvudsökande: Ulf Axelson
Organisation: Hushållningssällskapet Skaraborg
E-postadress: ulf.axelson@hushallningssallskapet.se
Telefon: 0511-24800
Beviljade medel: 175 000 SEK

Sammanfattning av slutrapport
I dagsläget görs graderingar av växtpatogener i sort och växtskyddsförsök genom okulär gradering. Systemet med okulär gradering har ett antal svagheter. Metoden är tidskrävande, kräver tillgång till kvalificerad personal och att olika personer graderar olika. Det finns också en stor risk att graderare helt missar förekomsten av patogener vid blandinfektioner. Det senare noterades också i denna undersökning.
Resultaten visar en mycket god samstämmighet mellan okulär gradering och kvantitativ PCR bestämning av svampsjukdomar i höstveteförsök. Jämfört med tidigare undersökningar där graderingen gjordes på olika bladmaterial visar denna undersökningen att det går att använda bägge arbetsmetoderna.
Resultaten visar också på fördelen med att PCR-tekniken kan upptäcka och diagnosticera patogener redan vid små angrepp (<1% angripen yta). Sammanfattningsvis tycks PCR-tekniken kunna ge en effektiv och säker gradering av växtpatogener i höstvete.

Populärvetenskaplig sammanfattning
Populärvetenskalig artikel, SLF projekt H1060230
Ulf Axelson Anders Jonsson
Hushållningssällskapet Skaraborg SLU, Skara

Jämförelse mellan okulär gradering och PCR-teknik för att bestämma angrepp av växtpatogener i höstvete.

I dagsläget görs graderingar av växtpatogener i sort och växtskyddsförsök genom okulär gradering. Systemet med okulär gradering har ett antal svagheter. Metoden är tidskrävande, den kräver tillgång till kvalificerad personal och det är ofta olika personer som graderar. Det finns också en risk att förväxla symptom på växtnäringsbrist eller fysiologiska fläckar med svampangrepp samt att graderare helt missar förekomsten av patogener vid blandinfektioner
I tidigare undersökningar har blad plockats och sedan delats upp i två grupper som antingen graderats okulärt eller analyserats med polymeras chain reaction, PCR-teknik. Till skillnad mot tidigare projekt gjordes i denna undersökning den okulära graderingen och bestämningen med PCR-teknik på samma blad.
Under sommaren 2010 har bladprover från obehandlade led i växtskyddsförsök i höstvete samlats in på Växtskyddscentralen i Skara. Plantor togs till laboratorium och från vardera led togs blad ut från respektive bladnivå ett till fyra. För varje blad och bladnivå graderades angreppsgraden av bladfläcksvampar okulärt i intervallen: 0, 0,1-1, 1-5, 5-10, 10-25, 25-50, 50-100 % angripen bladyta, samt vissna blad. Endast blad med synbara angrepp har torkats och sparats för senare PCR-analys. De sjukdomar som graderats okulärt var svartpricksjuka (Septoria tritici), vetets bladfläcksjuka (Drechslera tritici-repentis), mjöldagg (Erysiphe graminis ), brunrost (Puccinia recondita) och gulrost (Puccinia striiformis).
Proverna för PCR- analys skickades sedan till ScanBi Diagnostics AB, Alnarp och analyserades enligt den tidigare utvecklade PCR- tekniken för sjukdomarna S. tritici, D. tritici-repentis och brunfläcksjuka, Spagnospora.nodorum. PCR- tekniken bygger på att en för varje växtpatogen specifik DNA sekvens mångfaldigas, så att den kan detekteras i fall att den sökta patogenen finns i provet. Den art specifika DNA-strängen lokaliseras med en för den undersökta arten unik DNA-sekvens. Med hjälp av enzym byggs nya kopior av denna DNA-sträng och när mängden DNA når en viss kvantitet kan den detekteras i ett så kallat PCR- instrument. Innehållet av den sökta patogenen i ett prov kan sedan beräknas.

Metoden användbar i både forskning och praktiken
Resultaten visar en mycket god samstämmighet mellan kvantitativ PCR- analys och okulär gradering av svampsjukdomar i höstveteförsök. Den okulära graderingen missade helt förekomsten av både vetets bladfläcksjuka, D. tritici-repentis, och brunfläcksjuka, S. nodorum. Dessa två svampar upptäcktes däremot vid PCR- analysen. Den helt dominerande patogenen var svartpricksjuka, S. tritici, och den svamp vars angrepp skattades i den okulära graderingen.
Resultatet ligger i nivå med tidigare undersökningar där gradering och PCR analys inte gjorts på samma blad. Det verkar alltså vara likartade samband mellan PCR-värde och okulär gradering vare sig den görs på samma material eller på material som delats och analyserats var för sig. Nackdelen med att analysera på samma material är att risken för kontaminering borde öka något vilket skulle kunna ge låga ”falska” förekomster. Fördelen med att hantera ett mindre antal prov kan överväga men valet mellan att ta ett eller två separata prover blir främst beroende på frågeställning som skall besvaras.
Resultaten visar också på fördelen med att PCR-tekniken kan upptäcka och diagnostisera patogener redan vid små angrepp (<1% angripen yta).
När PCR-tekniken anammas så kommer flera av problemen med okulär besiktning att reduceras och slutsatserna från sortförsök och fungicidförsök att förbättras avsevärt. Även beslutsfattande kring växtsskyddsåtgärder i praktisk odling kommer att underlättas.

 

Antal träffar i projektbanken: 1580

Förbättrad arbetsmiljö inom hästnäringen genom nya metoder och verktyg
Cecilia Lindahl, RISE Research Institutes of Sweden

Projektnummer: H-17-47-281 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Although the equine sector in Sweden has gone through an expansion the last decades, the working methods have not changed. Working conditions must be improved to enable the horse industry to offer safe, sustainable and attractive jobs. The aim is to develop methods and tools for work environment …

Läs mer

Uppskatta vallens avkastning och näringsinnehåll genom spektral teknik
Margareta Emanuelson, Sveriges Lantbruksuniversitet

Projektnummer: R-18-62-989 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

The objective is to develop remote sensing methods to estimate forage nutrition and yield in the field in Northern Sweden. Field and lab measurements on grass-legume mixtures will be conducted from June 2018 to December 2019. At sampling time, drones flight with multispectral cameras, …

Läs mer

Från unghäst till atlet -förändringar över tid av rörelsesymmetrin hos trav- och ridhästar.
Marie Rhodin, Sveriges Lantbruksuniversitet

Projektnummer: H-16-47-178 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2016

Many horses in training show motion asymmetries, but it is not known if these are due to pain caused by training; or due to individual biological variations. The aim of this project is to initiate three cohort studies where changes in motion symmetry will be monitored over time in riding horses and …

Läs mer

Blodtilførselen til vekstbrusken i glideleddene, med relevans for utviklingssykdommer og spatt
Kristin Olstad, Norges miljø- og biovitenskapelige universitet

Projektnummer: H-16-47-192 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2016

The current project has a basic science and a clinical relevance part. The main project aim is to describe the blood supply to the growth cartilage of the small tarsal bones in young Icelandic Horses. Similar studies of the blood supply to long bones that ossify from three separate centers have …

Läs mer

Utveckling av den didaktiska processen i ridundervisning (Delstudie 3: Ridlärare-Häst)
Charlotte Lundgren, Linköpings universtitet

Projektnummer: H-17-47-278 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

'Work Package 3: Riding Instructor-Horse' is the final part of the project 'Improving Teaching Methods in Riding Education: the Interplay between Rider, Riding Instructor and Horse'. In this project, the Swedish-Norwegian Foundation for Equine Research has previously funded the first two work …

Läs mer

Golvunderlagets inverkan på kornas gång
Hans von Wachenfelt, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1430018 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2014

A primary reason for unhealthy legs and claws are unsuitable floor properties in dairy houses,
which may result in slippery floors and slip injuries to cows and mastitis.
The hygiene of a floor surface and floor properties affect the cow claw/floor interaction and gait.
The aim is to determine an …

Läs mer

Riskfaktorer för sjuklighet hos kalvar i den specialiserade köttproduktionen samt möjligheter till profylax.
Stefan Alenius, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: V1350026 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

Pneumonia is the most prevalent disease in Swedish feedlot cattle herds, causing mortality as well as affecting weight gain, rearing time and economy. Viral infections, including bovine respiratory syncytial virus (BRSV) and bovine coronavirus (BCV) as major actors, cause respiratory disease. …

Läs mer

Vad betyder "lean" för lantbruksföretagen?
Hans Andersson, Sveriges Lantbruksuniversitet - SLU

Projektnummer: H1346088 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2013

The competitiveness of Swedish agriculture is discussed extensively in media. Lean is a managerial strategy that developed in post-war Japan. Studies of manufacturing and service companies show better capacity utilization, quality control and ability to follow price signals. The issue is if lean …

Läs mer

Selektiv avmaskning mot blodmask – risker och möjligheter
Eva Tydén, Sveriges Lantbruksuniversitet

Projektnummer: H-15-47-097 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2015

Development of resistance to anthelmintics is a threat to equine welfare. As with antibiotics, restrictive use with anthelmintics in order to retain the effect is essential. Current recommendation for deworming is targeted selective treatment to individuals shedding a certain amount of parasite …

Läs mer

Hösilage"intolerans" hos häst?
Cecilia Müller, Sveriges Lantbruksuniversitet

Projektnummer: H-15-47-063 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2015

The purpose is to examine haylage 'intolerance' in horses, which is expressed as diarrhoeic faeces in some horses when they are fed haylage (sometimes also when fed hay). A typical appearance is two-phase faeces - one solid and one liquid. It is not known why or how this condition appears, and it …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress