Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Jämförelse mellan okulär gradering och PCR-teknik för att bestämma angrepp av växtpatogener i höstvete.

Status: Avslutat
Projektnummer: H1060230
Kategori: Research program | Field trial and method development
Ansökningsår: 2010
Datum för slutrapport: 16 juli 2012
Huvudsökande: Ulf Axelson
Organisation: Hushållningssällskapet Skaraborg
E-postadress: ulf.axelson@hushallningssallskapet.se
Telefon: 0511-24800
Beviljade medel: 175 000 SEK

Sammanfattning av slutrapport
I dagsläget görs graderingar av växtpatogener i sort och växtskyddsförsök genom okulär gradering. Systemet med okulär gradering har ett antal svagheter. Metoden är tidskrävande, kräver tillgång till kvalificerad personal och att olika personer graderar olika. Det finns också en stor risk att graderare helt missar förekomsten av patogener vid blandinfektioner. Det senare noterades också i denna undersökning.
Resultaten visar en mycket god samstämmighet mellan okulär gradering och kvantitativ PCR bestämning av svampsjukdomar i höstveteförsök. Jämfört med tidigare undersökningar där graderingen gjordes på olika bladmaterial visar denna undersökningen att det går att använda bägge arbetsmetoderna.
Resultaten visar också på fördelen med att PCR-tekniken kan upptäcka och diagnosticera patogener redan vid små angrepp (<1% angripen yta). Sammanfattningsvis tycks PCR-tekniken kunna ge en effektiv och säker gradering av växtpatogener i höstvete.

Populärvetenskaplig sammanfattning
Populärvetenskalig artikel, SLF projekt H1060230
Ulf Axelson Anders Jonsson
Hushållningssällskapet Skaraborg SLU, Skara

Jämförelse mellan okulär gradering och PCR-teknik för att bestämma angrepp av växtpatogener i höstvete.

I dagsläget görs graderingar av växtpatogener i sort och växtskyddsförsök genom okulär gradering. Systemet med okulär gradering har ett antal svagheter. Metoden är tidskrävande, den kräver tillgång till kvalificerad personal och det är ofta olika personer som graderar. Det finns också en risk att förväxla symptom på växtnäringsbrist eller fysiologiska fläckar med svampangrepp samt att graderare helt missar förekomsten av patogener vid blandinfektioner
I tidigare undersökningar har blad plockats och sedan delats upp i två grupper som antingen graderats okulärt eller analyserats med polymeras chain reaction, PCR-teknik. Till skillnad mot tidigare projekt gjordes i denna undersökning den okulära graderingen och bestämningen med PCR-teknik på samma blad.
Under sommaren 2010 har bladprover från obehandlade led i växtskyddsförsök i höstvete samlats in på Växtskyddscentralen i Skara. Plantor togs till laboratorium och från vardera led togs blad ut från respektive bladnivå ett till fyra. För varje blad och bladnivå graderades angreppsgraden av bladfläcksvampar okulärt i intervallen: 0, 0,1-1, 1-5, 5-10, 10-25, 25-50, 50-100 % angripen bladyta, samt vissna blad. Endast blad med synbara angrepp har torkats och sparats för senare PCR-analys. De sjukdomar som graderats okulärt var svartpricksjuka (Septoria tritici), vetets bladfläcksjuka (Drechslera tritici-repentis), mjöldagg (Erysiphe graminis ), brunrost (Puccinia recondita) och gulrost (Puccinia striiformis).
Proverna för PCR- analys skickades sedan till ScanBi Diagnostics AB, Alnarp och analyserades enligt den tidigare utvecklade PCR- tekniken för sjukdomarna S. tritici, D. tritici-repentis och brunfläcksjuka, Spagnospora.nodorum. PCR- tekniken bygger på att en för varje växtpatogen specifik DNA sekvens mångfaldigas, så att den kan detekteras i fall att den sökta patogenen finns i provet. Den art specifika DNA-strängen lokaliseras med en för den undersökta arten unik DNA-sekvens. Med hjälp av enzym byggs nya kopior av denna DNA-sträng och när mängden DNA når en viss kvantitet kan den detekteras i ett så kallat PCR- instrument. Innehållet av den sökta patogenen i ett prov kan sedan beräknas.

Metoden användbar i både forskning och praktiken
Resultaten visar en mycket god samstämmighet mellan kvantitativ PCR- analys och okulär gradering av svampsjukdomar i höstveteförsök. Den okulära graderingen missade helt förekomsten av både vetets bladfläcksjuka, D. tritici-repentis, och brunfläcksjuka, S. nodorum. Dessa två svampar upptäcktes däremot vid PCR- analysen. Den helt dominerande patogenen var svartpricksjuka, S. tritici, och den svamp vars angrepp skattades i den okulära graderingen.
Resultatet ligger i nivå med tidigare undersökningar där gradering och PCR analys inte gjorts på samma blad. Det verkar alltså vara likartade samband mellan PCR-värde och okulär gradering vare sig den görs på samma material eller på material som delats och analyserats var för sig. Nackdelen med att analysera på samma material är att risken för kontaminering borde öka något vilket skulle kunna ge låga ”falska” förekomster. Fördelen med att hantera ett mindre antal prov kan överväga men valet mellan att ta ett eller två separata prover blir främst beroende på frågeställning som skall besvaras.
Resultaten visar också på fördelen med att PCR-tekniken kan upptäcka och diagnostisera patogener redan vid små angrepp (<1% angripen yta).
När PCR-tekniken anammas så kommer flera av problemen med okulär besiktning att reduceras och slutsatserna från sortförsök och fungicidförsök att förbättras avsevärt. Även beslutsfattande kring växtsskyddsåtgärder i praktisk odling kommer att underlättas.

 

Antal träffar i projektbanken: 1712

Filtermaterialets påverkan på underhållsbehov, vattenkvalitet och skörd vid täckdikning
Eva Edin, Hushållningssällskapet HS Konsult AB

Projektnummer: JTI-21-83-606 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2021

The overall purpose of the project is to generate a base for recommendations for construction of new subsurface drainage and re-drainage of clay soils in the area Water - resource efficient management. Efficient drainage of arable land is important to increase crop production, to achieve …

Läs mer

Växtnäringseffekt hos nya gödselprodukter - Metodutveckling för kvalitetssäkring
Åsa Myrbeck, RISE, Jordbruk och Livsmedel

Projektnummer: JTI-20-83-494 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

For sustainable future development, it is essential to recirculate plant nutrients from different parts of society,
especially sewage plants, back to arable land. The aim of the proposed project is to ensure that high-quality fertiliser
products attractive for agricultural use are produced from …

Läs mer

Förbättrad utvärdering av officiella fältförsök genom bildanalys av drönarfoton med maskininlärning
Aakash Chawade

Projektnummer: O-20-23-462 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Crop production
Energy and biomass

The goal of the project is to digitize the data from the Swedish official field trials through automated estimates of important traits such as germination, growth, resistance, maturity and the effect of plant protection products. The purpose is to streamline and improve scoring of both diseases but …

Läs mer

Skötselåtgärder för ökad effektivitet genom ökad livslängd i mjölkkobesättningar
Mikaela Lindberg, Sveriges lantbruksuniversitet

Projektnummer: R-18-26-131 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

In the proposed project, we will explore the benefits of increasing the longevity of dairy cows under Swedish conditions by changes in herd management. We will focus on effects on methane emissions by modelling, using existing data from the Swedish Official Milk Recording Scheme and results from an …

Läs mer

Utsädesbehandling med ThermoSeed i kombination med mikroorganismer - en framtid utan kemisk betning
Mariann Wikström, Agro Plantarum AB

Projektnummer: R-19-25-287 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

The purpose of this project is to develop new non-chemical methods for control of different seedborne-and soilborne pathogens. Aerated steam treatment (ThermoSeed) is a modern and environmentally friendly method for seedborne pathogen sanitation, mainly used on cereals. We intend to develop the …

Läs mer

Från hav till mule - alger minskar metanemissioner från mjölkkor
Rebecca Danielsson

Projektnummer: O-20-23-461 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Meat
Milk

The purpose of this project is to investigate to what extent substances in algae inhibit microbial methane formation in cows. Several substances, so-called bioactive substances, in red, green and brown algae, have a significant methane reducing effect. These are promising results but in order to …

Läs mer

Att mäta och bedöma matens miljöpåverkan
Christel Cederberg, Chalmers Tekniska Högskola AB

Projektnummer: R-18-26-134 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Food production needs to increase in a sustainable way. This great challenge requires evaluation methods that gives information for better understanding of the impacts from agriculture and food and how to manage those impacts. The project addresses methodologies that include a broad range of …

Läs mer

Cannabinoider – Säkert foder, ren sport och framtida potential till häst
Matilda Lampinen Salomonsson, SVA

Projektnummer: H-19-47-486 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Cannabinoids have potential to induce analgesia and muscle relaxation which would be beneficial for equine practice. Today there is no drug labelled for veterinary use containing these cannabinoids, but there are some herbal oil products which unofficially have been reported to be used in horses, …

Läs mer

Vattenstress och sensorstyrd kvävegödsling: utveckling av beslutsstöd för bättre synergier mellan vatten- och kvävestatus
Bo Stenberg

Projektnummer: O-19-20-319 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Crop production
Energy and biomass

This project aims to modify existing sensor systems for adapted nitrogen fertilization to consider water stress at
supplementary fertilization in cereals. Different approaches to consider sensor data and soil information will be tested
in field trials. Current commercial systems interpret water …

Läs mer

Ursprungs- och artbestämning av kött – en ny snabbmetod för att upptäcka matfusk
Carl Brunius

Projektnummer: O-18-20-174 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Matfågel
Kött

A cornerstone of the Swedish Food Strategy is trust in Swedish food production. Yet each year Swedish farmers and food processors lose both money and trust due to food fraud, especially for non-Swedish meat relabelled as Swedish. Most fraud remains undetected. A recent analytical development, Rapid …

Läs mer
Prenumerera på vårt nyhetsbrev