Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Snabb och säker diagnos av patogener på rödklöver i jord och rot samt värmebahandling av rödklöverfrö för ökad utsädeskvalitet

Status: Avslutat
Projektnummer: H0960323
Kategori: Research program | Field trial and method development
Ansökningsår: 2009
Datum för slutrapport: 25 oktober 2013
Huvudsökande: Ann-Charlotte Wallenhammar
Organisation: HS Konsult AB
E-postadress: ac.wallenhammar@hush.se
Telefon: 019 - 603 27 00
Beviljade medel: 600 000 SEK

Sammanfattning av slutrapport
Uthålligheten hos rödklöver påverkas av rotröta. Tio framtids- och marknadssorter såddes i ett fältförsök, och prover togs vid sju tidpunkter i tre utvalda sorter. Real-tids PCR-metoder har utvecklats och vi har visat när de olika patogenerna finns i roten. Phoma spp och Cylindrocarpon destruktans fanns i samtliga analyserade rötter åtta veckor efter sådd. Förekomsten av Phoma spp. ökade kraftigt i slutet av säsongen, medan ingen tydlig trend för C. destruktans kunde påvisas. Fusarium avenaceum förekom endast i mycket låga mängder i juni och juli, och först i augusti var detektionen mer frekvent. F.culmorum förkom sporadiskt. Fem utvalda fröpartier med låg grobarhet, < 80 % behandlades med Thermoseedmetoden (TS). TS-behandlingen minskade antalet infekterade frön i ett parti med hög smitta. TS-behandlingen påverkade inte uppkomsten i krukförsök, men sänkte uppkomsten inledningsvis i fältförsök. Inga skillnader i sjukdomsangrepp mellan behandlingar eller sorter kunde påvisas.

Populärvetenskaplig sammanfattning
Syftet med studien

Rödklöver är en viktig proteingröda och en bärande komponent i slåttervallar. Uthålligheten hos växten har kraftigt försämrats och bestånden är ofta angripna av rotröta redan insåningsåret. Syftet var dels att utveckla molekylärbiologiska metoder med hög specificitet för att kvantifiera de svampar som ingår i rotrötekomplexet, och dels att undersöka om termisk utsädessanering av rödklöverfröutsäde kan förbättra grobarhet och fältetablering. Med dessa metoder kan vi effektivt börja utreda betydelsen av olika smittvägar, effekter av odlingsåtgärder och sortval för angrepp av rotröta i rödklöver.

Resultat
Vi har utvecklat verktyg, en real-tids PCR-metod och kan för första gången fastställa när i tid de olika patogenerna som orsakar rotröta finns i roten. Analyserna visar att både Phoma spp och Cylindrocarpon destruktans fanns i samtliga analyserade rötter vid första provtagningstillfället åtta veckor efter sådd. Förekomsten av Phoma spp. ökade kraftigt i samtliga sorter i november, vilket visar att svampen är en viktig patogen i utvecklingen av rotröta. För C. destruktans finns ingen tydlig trend i förändring över tid, vilket kan tolkas som att patogenen infekterat roten, men sedan inte tillväxer. Fusarium avenaceum som anses bidra mest till skadorna i rötterna påträffades endast i mycket låga mängder i juni och juli, och först i augusti var detektionen mer frekvent. Det enskilt högsta värdet bestämdes i plantor tagna i november. F.culmorum kunde endast påvisas i mycket liten mängd i ett av de analyserade proverna. Utvecklingen av svampförekomsten följs med analyser i vall I och vall II.

Isolering av svampar som utsädespartierna som tillhör rotrötekomplexet visade att smittan var störst i Bjurselepartiet, med 57 % infekterade frön. Thermoseedbehandlingen minskade antalet infekterade frön till 7 % . Uppkomsten påverkades inte av Thermoseed behandlingen i växthus försöket, medan Thermoseedbehandlade frön hade en statistiskt lägre uppkomst i fältförsöket. Vid andra avläsningen i fält hade skillnaden utjämnats, men det fanns en stark tendens till lägre uppkomst för Thermoseedbehandlade frön. Det fanns inga tydliga skillnader i sjukdomsangrepp mellan partierna eller mellan behandlingarna

Metod
Molekylärbiologiska metoder med hög specificitet, realtids PCR-metoder har utvecklats
för de svampar som orsakar rotröta; Fusarium avenaceum, Fusarium culmorum, Cylindrocarpon destructans, Phoma exigua och Phoma medicaginis. En metod för en universal växtgen (COX) har satts upp och denna referensgen används i växtprover, och vidare har metoder för att extrahera svamparnas DNA från rötterna utvecklats.

Fem utvalda fröpartier med låg grobarhet, dvs. mellan 67 % och 76 %, värmebehandlades med Thermoseedmetoden av Incotech AB. Patogena svampar isolerades på agarplattor och svampkulturena undersöktes med mikroskopi och identifierades. Thermoseedbehandlade och obehandlade frön av samtliga fröpartier såddes i plastkrukor i växthus. Antalet uppkomna plantor bestämdes vid två tillfällen, och vid försökets avslut efter två månader bestämdes sjukdomssymtom i rötterna. Fröpartierna såddes sedan i ett fältförsök med fyra upprepningar, planträkning gjordes vid två tillfällen, och i slutet av oktober togs prover för sjukdomsbestämning.
Ett testsortiment av tio framtids- och marknadssorter utvaldes i samråd med förädlare och sortföreträdare, och såddes i ett fältförsök i Götene. Prover togs i samtliga led den 30 juni och 5 november och därefter i tre utvalda led vid sju tidpunkter tom 22 september 2011. Sjukdomsangrepp i rötterna bestämdes vid varje tidpunkt.

Slutsatser och råd till näringen.
Rödklöverns korta varaktighet är ett stort problem i vallodlingen och ger snabbt förändrad sammansättning så att de insådda gräsen dominerar. I ekologiska odlingssystem baseras kväveförsörjningen på den symbiotiska kvävefixeringen hos baljväxter, men den svaga uthålligheten försämrar både kvantitet och kvalitet. Ofta återkommande odling på samma fält ger en uppförökning av markbunden smitta som snabbt kan förändra rödklöverbeståndet. De molekylärbiologiska metoder som vi utvecklat ger oss möjlighet att utreda effekter av odlingsåtgärder och identifiera tillvägagångssätt för att stärka uthålligheten i lokalproducerade vallbaljväxter. Thermoseedbehandling kan vara en möjlig väg för att sanera infekterat utsäde.

 

Antal träffar i projektbanken: 1676

Förbättrad utvärdering av officiella fältförsök genom bildanalys av drönarfoton med maskininlärning
Aakash Chawade

Projektnummer: O-20-23-462 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Crop production
Energy and biomass

The goal of the project is to digitize the data from the Swedish official field trials through automated estimates of important traits such as germination, growth, resistance, maturity and the effect of plant protection products. The purpose is to streamline and improve scoring of both diseases but …

Läs mer

Fullständiga växthusgasbudgetar för odlade mulljordar skapar underlag för klimatsmarta åtgärder
Achim Grelle

Projektnummer: O-18-23-169 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Växtodling
Energi & biomassa
Kött
Mjölk

Conventional technology is virtually unable to measure complete GHG budgets of drained organic soils, which may provide misleading results. So, global estimates of GHG emissions are based on coarse assumptions that don’t take into account the complexity of agroecosystems. Better data are needed for …

Läs mer

Mjölkfettsyror - verktyg för att hitta kor med ökad risk för ämnesomsättningssjukdomar och reproduktionsstörningar
Kjell Holtenius

Projektnummer: O-19-20-306 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Milk

The overall objective of this project is to create milk biomarkers based on specific milk fatty acids for identification of cows with reproductive disorders and metabolic disturbances. Milk will be analysed by Fourier-transform mid-infrared technology. An important value of this project for the …

Läs mer

Vattenstress och sensorstyrd kvävegödsling: utveckling av beslutsstöd för bättre synergier mellan vatten- och kvävestatus
Bo Stenberg

Projektnummer: O-19-20-319 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Crop production
Energy and biomass

This project aims to modify existing sensor systems for adapted nitrogen fertilization to consider water stress at
supplementary fertilization in cereals. Different approaches to consider sensor data and soil information will be tested
in field trials. Current commercial systems interpret water …

Läs mer

Utveckling av den didaktiska processen i ridundervisning (Delstudie 3: Ridlärare-Häst)
Charlotte Lundgren, Linköpings universtitet

Projektnummer: H-17-47-278 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

'Work Package 3: Riding Instructor-Horse' is the final part of the project 'Improving Teaching Methods in Riding Education: the Interplay between Rider, Riding Instructor and Horse'. In this project, the Swedish-Norwegian Foundation for Equine Research has previously funded the first two work …

Läs mer

Validering av prebiotiska och antioxidanta effekter av vetekli hemicellulosor i bakprodukter
Francisco Vilaplana

Projektnummer: O-17-20-962 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Socker

Wheat bran is the largest by-product of wheat flour production with approximately 300,000 tonnes in Sweden. Bran is mainly used in animal feed, as human digestion is not fully able to absorb it. Wheat bran contains valuable biomolecules, such as dietary fiber (arabinoxylans, AX) and phenolic …

Läs mer

Säkrad mikrobiell kvalitet hos grovfoder och mjölkråvara för lönsam produktion av långlagrad ost
Åse Lundh

Projektnummer: O-16-20-764 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2016

Mjölk

Increased production and export of products with high added values, e.g. long-ripened hard cheeses, are considered important steps for a positive development of the Swedish dairy sector. Increased investment in Swedish premium cheese will, however, require increased volumes of high quality raw milk …

Läs mer

Tidiga larm om produktionsstörningar för snabbare åtgärd och minskade förluster i grisföretag
Fernanda Cetrangolo Dórea

Projektnummer: O-17-20-978 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Kött

Disease and production disturbances in a herd are often silent, and may cause major losses if they remain undetected. Continuous analysis and monitoring of data already recorded at the farm level can improve profitability. This project will develop methods for monitoring trends in production and …

Läs mer

Individuellt anpassad laktationslängd för lönsam och hållbar mjölkproduktion
Kjell Holtenius

Projektnummer: O-17-20-957 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Mjölk

The aim of the project is to develop tools which can be used for individually adapted lactation lengths based on the biological conditions of the cow. Today a one year calving interval and a short lactation period, is recommended. The recommendations are based on 30 years old information and do not …

Läs mer

Ursprungs- och artbestämning av kött – en ny snabbmetod för att upptäcka matfusk
Alastair Ross

Projektnummer: O-18-20-174 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Matfågel
Kött

A cornerstone of the Swedish Food Strategy is trust in Swedish food production. Yet each year Swedish farmers and food processors lose both money and trust due to food fraud, especially for non-Swedish meat relabelled as Swedish. Most fraud remains undetected. A recent analytical development, Rapid …

Läs mer
Prenumerera på vårt nyhetsbrev