Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Utvärdering av Clostridium perfringens typ A och Clostridium difficiles koppling till spädgrisdiarré

Status: Avslutat
Projektnummer: O-16-20-768
Kategori: Focus area | Food & feed
Branschområden: Kött
Ansökningsår: 2016
Datum för slutrapport: 24 augusti 2020
Huvudsökande: Magdalena Jacobson
Organisation: Magdalena Jacobson
E-postadress: magdalena.jacobson@slu.se
Telefon: +4618671475
Medsökande: Anna Aspán
Medsökande: Lena Eliasson Selling
Beviljade medel: 1 711 000 SEK

During the last decade, neonatal porcine diarrhoea (NPD) has become an increased problem in Swedish herds. Clostridium (C.) perfringens type A (CpA) and C. difficile (Cd) have been highlighted as causes of NPD but their importance has also been questioned. We have previously demonstrated that CpA and Cd can be found in both diarrhoeic and healthy piglets. However, since pathogenic strains of CpA and Cd cannot be differentiated from strains found in healthy pigs and the diagnostic value of toxin-detection in stool is uncertain we have neither been able to confirm or rule them out as the cause of disease. To fill these knowledge gaps, we now want to proceed with comprehensive comparisons of CpA strains isolated from diarrhoeic and healthy piglets and evaluate if Cd-toxin can be detected in faeces from healthy piglets. This will either weaken or strengthen the association between these bacteria and NPD and generate information that can be used for the development of reliable diagnostics.

Under det senaste decenniet har spädgrisdiarré blivit ett vanligt problem i Svenska besättningar. Clostridium (C.) perfringens typ A (CpA) och C. difficile (Cd) har pekats ut som orsaker till spädgrisdiarré men deras betydelse är omtvisad. Vi har tidigare påvisat CpA och Cd hos både sjuka och friska grisar men vare sig kunnat fastställa eller utesluta dem som orsak till sjukdom. I nuläget kan man nämligen inte skilja på sjukdomsorsakande stammar av dessa bakterier och de stammar som man normalt hittar i tarmen. Man vet inte heller vad påvisande av dessa bakteriers toxiner i träck har för betydelse. För att fylla dessa kunskapsluckor vill vi nu gå vidare med omfattande jämförelser mellan stammar av CpA isolerade från sjuka och friska grisar samt även utvärdera om Cd-toxin kan påvisas i träck från friska grisar. Detta kommer antingen att tala för eller emot att dessa bakterier orsakar spädgrisdiarré samt generera information som kan användas för utveckling av tillförlitlig diagnostik.

Under det senaste decenniet har spädgrisdiarré blivit allt vanligare både i Sverige och andra länder. I en tidigare studie har vi visat att från tio gårdar med diarré-problem, var, i hälften av besättningarna, Enterococcus hirae den troligen orsaken. På alla gårdar hittades Clostridium perfringens typ A (CpA) och C. difficile (CD). Dessa två bakterie-arter hittas ofta vid spädgrisdiarré, men även hos friska spädgrisar. Vi ville därför undersöka om vi kunde finna genetiska skillnader mellan isolat av CpA från friska respektive sjuka djur. Analyser av över 200 isolat av CpA kunde inte särskilja grupperna. Det är därför inte troligt att CpA är en orsak till ökningen av spädgrisdiarrér. Snabbtester för påvisande av Cd-toxin har använts för att diagnostisera CD som sjukdomsorsak. Vi undersökte därför om Cd-toxin kunde påvisas i träck från friska gspädrisar. Eftersom så var fallet kan vi inte rekommendera denna typ av snabbtester för att fastställa orsaken till spädgrisdiarrér.

Bakgrund
Vår forskning om anledningen till ökningen av spädgrisdiarré (NPD) i Sverige indikerar att det kan finnas mer än en orsak. En tidigare studie av tio drabbade grisbesättningar visade att Enterococcus hirae var den troliga orsaken till sjukdom på ca hälften av gårdarna. I alla besättningar var bakterier som vanligen förknippas med spädgrissjukdom antingen frånvarande, Clostridium perfringens typ C, eller sällsynta, ETEC. Dock hittades C. perfringens (Cp) typ A och C. difficile (CD) i alla besättningar. Dessa bakterier betraktas ofta som sjukdomsorsakande. Även om få studier har utförts på friska spädgrisar verkar C. perfringens typ A och C. difficile förekomma lika vanligt på gårdar som inte rapporterat NPD som drabbade gårdar.

Syfte, mål, metoder och resultat
För att grundligare utreda Cp & CD:s roll vid spädgrisdiareér, har prover och bakterieisolat från fem friska besättningar och fem besättningar med problem med NPD jämförts med olika diagnosiska och molekylära tmetoder.

Projektet hade tre huvudmål och slutsatsen för vart och ett av dessa mål presenteras nedan:

Mål: 1 & 2: Undersöka diversiteten hos CpA-isolat från friska spädgrisar och smågrisar med diarré, samt karaktärisera ev. genetiska skillnader i CpA-stammar isolerade från friska respektive sjuka djur.

Den genetiska diversiteten hos CpA-isolat visade sig vara låg, grundat på typning med cpn60 gen sekvensering och 6-loci MLVA. Baserat på dessa två metoder samt helgenomsekvensering följt av nukleoidpolymorfism-analys av en utvald grupp isolat, kunde inga genetiska skillnader mellan friska och diarrégrisar påvisas. Resultaten talar för att CpA som orsak till NPD i dessa besättningar är osannolikt. Det är dock fortfarande möjligt att även om isolaten är mycket lika genetiskt, kan de ha förvärvat olika virulensgener. Innan vi publicerar våra resultat kommer vi därför att göra en djupare undersökning av helgenom-data för olika virulens- och adhesionsfaktorer, som kan skilja sig även inom genetiska subtyper.

Mål 3. Undersök om Cd-toxin kan detekteras i feces från friska nyfödda grisar

Närvaron av CD i avföring hos friska spädgrisar kunde bekräftas med ett antigen test, och produktion av toxiner kunde påvisas i några av avföringsproven med samma metod. Eftersom Cd-toxiner kan upptäckas i feces från friska spädgrisar från gårdar med friska djur, kan tester som CDqc inte användas för att diagnostisera CD som orsak till diarréer. kunde CD kunde isoleras från en majoritet av friska djur. Med samma antigentest som användes för avföringsproven, kunde alla, utom ett, isolat producera CD-toxiner in vitro. Alla isolat visade sig också bära på Cd-toxegener med qPCR.

Nytta för näringen & rekommendationer:

Vår forskning om orsakerna till ökningen av diarré hos spädgrisar indikerar att det kan finnas mer än en orsak.

För att utveckla riktlinjer för antimikrobiell behandling, specifika och känsliga diagnostiska metoder och effektiva förebyggande åtgärder, måste det orsakande patogenen vara känt. Detta projekt syftade således till att belysa Cp och CD: s roll i NPD i Sverige. Våra resultat visar att Cp och CD är osannolika orsaker till diarré hos spädgrisar. Båda bakterie-arterna var lika vanligt förekommande hos friska som sjuka djur. För Cp fann vi en låg genetisk diversitet mellan isolat och inga uppenbara genetiska skillnader mellan isolat från dessa två grupper av djur. Därför är vaccination och / eller antibiotikabehandling mot Clostiridier (främst CpA) troligen onödigt.

Båda bakterie-arterna har emellertid förmåga att bära olika virulensegenskaper oavsett genetisk subtyp. De nya genomiska verktygen som nu finns tillgängliga, såsom helgenomsekvensering, öppnar möjligheterna att ytterligare karakterisera vår isolatsamling.

Det kan noteras att genom helgenomsekvensering kunde vi visa att varje gård hade olika CD-varianter, varianter som tidigare har associerats med sjukdom hos människa. Denna kunskap är viktig för att förhindra CD-infektion hos djurägare eller deras personal.

 

Antal träffar i projektbanken: 1676

Tredje steget i en 3-stegsraket – kalkens potential för struktur, växtnäring växtskydd och ekonomi
Anita Gunnarsson,

Projektnummer: O-15-20-357 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 30 maj 2019

Växtodling
Potatis

Lime is known to have many positive effects, some of which can be unexpected. The proposed study will measure the effects of carbonate lime (CaCO3) and mixed lime (CaCO3 and Ca(OH)2) on all crops in a rotation (cereal, oilseed rape, canning peas, potatoes). The combined effects of liming on soil …

Läs mer

Inverkan av såtidpunkt och utsädesmängd på avkastningen hos aktuella typsorter av höstvete. Forts.
Jannie Hagman

Projektnummer: O-16-20-746 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 27 maj 2019

Växtodling

In an ongoing project, funded by SLF, examines the effect of sowing time and seed rate on yield. Two field trials were established in autumn 2014 respectively 2015 in Skåne and Östergötland. Now we are looking for funding to expand the project with a third trial year. Two years is too short time to …

Läs mer

Kan förbättrad syresättning med pulsad inhalerad NO under hästanestesi öka patientsäkerheten?
Görel Nyman, SLU

Projektnummer: H-14-47-023 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 22 maj 2019

Poor oxygenation of blood that occurs when a horse is anesthetized and placed on its back is a critical risk factor for anesthetic complications, and the risk of complications from low oxygen continues into anesthetic recovery. When nitric oxide (NO) is delivered as a pulse in the beginning of the …

Läs mer

Bättre modersegenskaper och hållbarhet med selektion grundad på genomisk information och registreringar från korsningssuggor
Elisenda Rius-Vilarrasa, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H1350210 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 10 maj 2019

The project aims to develop a novel strategy to improve longevity and maternal traits in a pig breeding program. We will evaluate the use of genetic markers on crossbred animals to strength pig breeding. A method called genomic selection (GS) will be used, which utilizes DNA-markers for the genetic …

Läs mer

Registreringar från automatiska mjölkningssystem som informationskälla i genomisk avelsvärdering
Freddy Fikse, SLU

Projektnummer: V1330048 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 2 maj 2019

Genomic selection is revolutionizing animal breeding, since selection is based on the joint genetic merit of all SNP alleles across the genome. Lack of accurate and frequent data, however, forms the most important barrier to realize the full potential of genomic selection. There is on the other …

Läs mer

Ökad lönsamhet med nya avelsverktyg i mjölkkobesättningarna
Anna Näsholm, Sveriges lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: V1330025 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 27 april 2019

The aim is to study the possibility to improve profitability on herd level in Swedish milk production by using sexed semen and genotyping heifers in the dairy herds and combine this with planned crossbreeding and use of beef semen. For this purpose we will estimate genetic progress and do economic …

Läs mer

Utveckling av den didaktiska processen i ridundervisning: samspelet mellan ryttare, ridlärare och häst (Delstudie 2: ryttare-ridlärare)
Charlotte Lundgren, Linköpings universitet

Projektnummer: H1347083 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 12 april 2019

In this second subproject we focus the analyses of the material collected during the first subproject project "Improving teaching methods in riding education: the interplay between rider, riding instructor and horse", funded by the The Swedish-Norwegian Foundation for Equine Research,on the …

Läs mer

Utökad samhällsekonomisk modell för hästnäringen: Hur konsumtionen varierar över region och hästtyp
Tobias Heldt, Högskolan Dalarna

Projektnummer: H-16-47-195 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 29 mars 2019

The overall research question for this project can be stated as: How do the regional economic effects of the horse industry look like and how does the horse related consumption differ depending on type of horse? Method wise, interviews and questionnaires are used to collect new data to estimate …

Läs mer

Småskalig uppgradering av biogas och utvinning av koncentrerat kvävegödselmedel
Gustav Rogstrand,

Projektnummer: O-15-22-361 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 19 mars 2019

Energi & biomassa
Kött
Mjölk

This project is intended to demonstrate a cost effective concept for small-scale production and utilization of biomethane as vehicle fuel and extraction of concentrated ammonium nitrogen fertilizer. The system is composed of standard components that are commonly used in farm scale biogas …

Läs mer

Antikroppar mot hästinfluensa i verkligheten - en studie av vaccinerade svenska travhästar i träning
Eva Wattrang, Statens Veterinärmedicinsk Anstalt (SVA)

Projektnummer: H-16-47-174 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 6 mars 2019

Equine influenza is one of the most important infectious diseases in horses and outbreaks cause considerable economical losses for the horse industry. Prophylactic vaccination is the most effective measure to prevent clinical disease and to limit the spread of infection. It is therefore imperative …

Läs mer
Prenumerera på vårt nyhetsbrev