Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Utveckling av beslutsstöd för riskbedömning av Sclerotinia sclerotiorum i vårraps genom kvantifiering av luftburen smitta och studier av infektionsprocessen

Status: Avslutat
Projektnummer: H0960195
Kategori: Research program | Field trial and method development
Ansökningsår: 2009
Datum för slutrapport: 3 november 2014
Huvudsökande: Ann-Charlotte Wallenhammar
Organisation: HS Konsult AB
E-postadress: ac.wallenhammar@hush.se
Telefon: 019 - 603 27 00
Beviljade medel: 740 000 SEK

Bomullsmögel som orsakas av Sclerotinia sclerotiorum, överlever med vilkroppar i jorden. S.sclerotiorum- DNA bestämdes med realtids PCR på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk i två fältförsök 2010. DNA påvisades på samtliga bladnivåer vid första provtagningen, och andel blad med DNA var statistiskt signifikant större för lägst sittande blad. Frånvaron av DNA på kronbladen i ett av försöken visar att den gängse uppfattningen om kronbladens betydelse för infektion måste omvärderas. Analyser av luftprover visade att sporspridningen avtagit innan blomningen. Test av verktygen i tio praktiska odlingar 2011 visade S.sclerotiorum DNA i samtliga fält, företrädesvis på lägst sittande blad vid andra provtagningen. Jordanalyserna, de första i sitt slag, visar förekomst i 55 % av fälten där odlingsuppehållet i de flesta fall överstiger tio år vilket är ett banbrytande upptäckt. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras.

Nya DNA-baserade verktyg banbrytande för riskbedömning av bomullsmögel i vårraps
Resultat
Svamp- DNA fanns på stjälkens blad vid första provtagningen i fältförsöken. Andelen blad med DNA ökade ju längre ner i beståndet bladen satt, och skillnaden mellan översta och lägst sittande blad var statistisk säkerställd. DNA påvisades inte på kronbladen vid någon av provtagningarna i ett av försöken, medan svampen samtidigt fanns på bladen. Analyserna av luftproven visar att sporspridningen hade upphört när blomningen började, och detta samband är banbrytande då infekterade kronblad tidigare ansetts vara källan till infektion. Test av verktygen i tio praktiska odlingar med stor variation i såtidpunkt visade att svamp- DNA fanns i samtliga fält, företrädesvis på lågt sittande blad vid andra provtagningen. Analyserna av luftproven 2011 visar att sporspridningen startade efter första provtagningen och sammanföll väl med andra provtagningen. Trots att odlingsuppehållet till föregående rapsgröda var mer än tio år, påvisade vi svamp- DNA på bladen i samtliga fält. Jordanalyserna, som är de första vi känner till, visade att spår av svampens vilkroppar fanns i 55 % av fälten.
Metod
Vi har bestämt svampens DNA med realtids-PCR teknik på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk. Två fältförsök anlades 2010 i befintliga odlingar av SW Joplin i Örebro län. Blad från plantans stjälk och kronblad samlades in var 5:e dag, med början den 21 juni, strax före blomning, och avslutades den 14 juli. Proverna förpackades och förvarades i frys. Sporfällan, Burkhard 7-day Spore trap, placerades i fält 25 maj - 1 augusti 2010 och 24 maj- 25 juli 2011, för att fånga in avgörande händelser. Tejpen byttes veckovis och klipptes i delar motsvarande dygnsfångster, innan de preparerades för molekylär diagnostik. Utvärdering av metoderna gjordes i tio fält 2011 då två provtagningar gjordes, den första i tidig blomning och den andra en vecka senare. Kronblad, de översta och lägst sittande bladen från tio plantor analyserades. I varje testyta togs jordprov för DNA- analys, och angreppet i beståndet bestämdes.
Slutsats och råd till näringen
Oljeväxtodlingen ökar, framförallt på gårdar där raps odlas regelbundet. Ökad frekvens av oljeväxter i växtföljden ökar risk för angrepp av bomullsmögel, en svamp som överlever med vilkroppar i jorden . Beslut om fungicidbehandling måste tas innan symtomen är synliga, och kräver att odlaren gör en aktiv riskbedömning.
Vi presenterar banbrytande verktyg för riskbedömning baserade på analys av svamp- DNA. Dessa metoder ger oss ny information om t ex svampar som tidigare inte kunde identifieras visuellt med mikroskop eller med agarplattor. Riskbedömning baserad på analys av svampens DNA på de lägst sittande bladen är ett effektivt verktyg för att lokalisera fältsmitta. Hur stort angreppet blir beror ytterst på väderleken, framförallt luftfuktigheten i beståndet, under blomningen. Analys av luftprover ger oss information som tydligt visar när sporspridningen startar på en bestämd lokal, och vi har sett att denna tidpunkt varierar mellan år. Sporfällor är ett effektivt verktyg som inte använts tidigare som vi anser har stor potential, och bör utvecklas vidare.
Vi har också visat att blommans kronblad, som tidigare varit huvudspåret när olika metoder testats, framstår som en osäker väg. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras. Fältbaserade tester har en stor potential, och fortsatt utveckling av nya s k isotermiska DNA-baserade metoder kan förenkla analysproceduren ytterligare. Utveckling av sporfällor och optimering av tekniken så att analyser dagligen kan sändas som textmeddelanden tillsammans med lokala väderprognoser kommer att vara hörnpelare i en aktiv prognosmodell.
Sammantaget ger våra nya resultat en stor affärsnytta för lantbrukaren, då en fältbaserad analys ger svar på om svampen finns i beståndet, och en behovsanpassad fungicidbehandling minskar avtrycken i miljön.

 

Antal träffar i projektbanken: 1676

Förbättrad utvärdering av officiella fältförsök genom bildanalys av drönarfoton med maskininlärning
Aakash Chawade

Projektnummer: O-20-23-462 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Crop production
Energy and biomass

The goal of the project is to digitize the data from the Swedish official field trials through automated estimates of important traits such as germination, growth, resistance, maturity and the effect of plant protection products. The purpose is to streamline and improve scoring of both diseases but …

Läs mer

Fullständiga växthusgasbudgetar för odlade mulljordar skapar underlag för klimatsmarta åtgärder
Achim Grelle

Projektnummer: O-18-23-169 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Växtodling
Energi & biomassa
Kött
Mjölk

Conventional technology is virtually unable to measure complete GHG budgets of drained organic soils, which may provide misleading results. So, global estimates of GHG emissions are based on coarse assumptions that don’t take into account the complexity of agroecosystems. Better data are needed for …

Läs mer

Mjölkfettsyror - verktyg för att hitta kor med ökad risk för ämnesomsättningssjukdomar och reproduktionsstörningar
Kjell Holtenius

Projektnummer: O-19-20-306 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Milk

The overall objective of this project is to create milk biomarkers based on specific milk fatty acids for identification of cows with reproductive disorders and metabolic disturbances. Milk will be analysed by Fourier-transform mid-infrared technology. An important value of this project for the …

Läs mer

Forståelse av etiologien bak acquired equine polyneuropathy via studier av Schwanske celle kulturer
siv Hanche-Olsen, NMBU Veterinærhøgskolen

Projektnummer: H-18-47-409 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Acquired equine polyneuropathy (AEP) is a devastating neurologic disease affecting Nordic horses. Characteristic histopathological changes have been shown in the peripheral nerves of horses euthanized due to the disease. These include re- and demyelination as well as hypertrophy of perikaria and …

Läs mer

Vattenstress och sensorstyrd kvävegödsling: utveckling av beslutsstöd för bättre synergier mellan vatten- och kvävestatus
Bo Stenberg

Projektnummer: O-19-20-319 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Crop production
Energy and biomass

This project aims to modify existing sensor systems for adapted nitrogen fertilization to consider water stress at
supplementary fertilization in cereals. Different approaches to consider sensor data and soil information will be tested
in field trials. Current commercial systems interpret water …

Läs mer

Cannabinoider – Säkert foder, ren sport och framtida potential till häst
Matilda Lampinen Salomonsson, SVA

Projektnummer: H-19-47-486 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Cannabinoids have potential to induce analgesia and muscle relaxation which would be beneficial for equine practice. Today there is no drug labelled for veterinary use containing these cannabinoids, but there are some herbal oil products which unofficially have been reported to be used in horses, …

Läs mer

Utveckling av den didaktiska processen i ridundervisning (Delstudie 3: Ridlärare-Häst)
Charlotte Lundgren, Linköpings universtitet

Projektnummer: H-17-47-278 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

'Work Package 3: Riding Instructor-Horse' is the final part of the project 'Improving Teaching Methods in Riding Education: the Interplay between Rider, Riding Instructor and Horse'. In this project, the Swedish-Norwegian Foundation for Equine Research has previously funded the first two work …

Läs mer

Validering av prebiotiska och antioxidanta effekter av vetekli hemicellulosor i bakprodukter
Francisco Vilaplana

Projektnummer: O-17-20-962 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Socker

Wheat bran is the largest by-product of wheat flour production with approximately 300,000 tonnes in Sweden. Bran is mainly used in animal feed, as human digestion is not fully able to absorb it. Wheat bran contains valuable biomolecules, such as dietary fiber (arabinoxylans, AX) and phenolic …

Läs mer

Säkrad mikrobiell kvalitet hos grovfoder och mjölkråvara för lönsam produktion av långlagrad ost
Åse Lundh

Projektnummer: O-16-20-764 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2016

Mjölk

Increased production and export of products with high added values, e.g. long-ripened hard cheeses, are considered important steps for a positive development of the Swedish dairy sector. Increased investment in Swedish premium cheese will, however, require increased volumes of high quality raw milk …

Läs mer

Tidiga larm om produktionsstörningar för snabbare åtgärd och minskade förluster i grisföretag
Fernanda Cetrangolo Dórea

Projektnummer: O-17-20-978 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2017

Kött

Disease and production disturbances in a herd are often silent, and may cause major losses if they remain undetected. Continuous analysis and monitoring of data already recorded at the farm level can improve profitability. This project will develop methods for monitoring trends in production and …

Läs mer
Prenumerera på vårt nyhetsbrev