Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Utveckling av beslutsstöd för riskbedömning av Sclerotinia sclerotiorum i vårraps genom kvantifiering av luftburen smitta och studier av infektionsprocessen

Status: Avslutat
Projektnummer: H0960195
Kategori: Research program | Field trial and method development
Ansökningsår: 2009
Datum för slutrapport: 3 november 2014
Huvudsökande: Ann-Charlotte Wallenhammar
Organisation: HS Konsult AB
E-postadress: ac.wallenhammar@hush.se
Telefon: 019 - 603 27 00
Beviljade medel: 740 000 SEK

Bomullsmögel som orsakas av Sclerotinia sclerotiorum, överlever med vilkroppar i jorden. S.sclerotiorum- DNA bestämdes med realtids PCR på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk i två fältförsök 2010. DNA påvisades på samtliga bladnivåer vid första provtagningen, och andel blad med DNA var statistiskt signifikant större för lägst sittande blad. Frånvaron av DNA på kronbladen i ett av försöken visar att den gängse uppfattningen om kronbladens betydelse för infektion måste omvärderas. Analyser av luftprover visade att sporspridningen avtagit innan blomningen. Test av verktygen i tio praktiska odlingar 2011 visade S.sclerotiorum DNA i samtliga fält, företrädesvis på lägst sittande blad vid andra provtagningen. Jordanalyserna, de första i sitt slag, visar förekomst i 55 % av fälten där odlingsuppehållet i de flesta fall överstiger tio år vilket är ett banbrytande upptäckt. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras.

Nya DNA-baserade verktyg banbrytande för riskbedömning av bomullsmögel i vårraps
Resultat
Svamp- DNA fanns på stjälkens blad vid första provtagningen i fältförsöken. Andelen blad med DNA ökade ju längre ner i beståndet bladen satt, och skillnaden mellan översta och lägst sittande blad var statistisk säkerställd. DNA påvisades inte på kronbladen vid någon av provtagningarna i ett av försöken, medan svampen samtidigt fanns på bladen. Analyserna av luftproven visar att sporspridningen hade upphört när blomningen började, och detta samband är banbrytande då infekterade kronblad tidigare ansetts vara källan till infektion. Test av verktygen i tio praktiska odlingar med stor variation i såtidpunkt visade att svamp- DNA fanns i samtliga fält, företrädesvis på lågt sittande blad vid andra provtagningen. Analyserna av luftproven 2011 visar att sporspridningen startade efter första provtagningen och sammanföll väl med andra provtagningen. Trots att odlingsuppehållet till föregående rapsgröda var mer än tio år, påvisade vi svamp- DNA på bladen i samtliga fält. Jordanalyserna, som är de första vi känner till, visade att spår av svampens vilkroppar fanns i 55 % av fälten.
Metod
Vi har bestämt svampens DNA med realtids-PCR teknik på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk. Två fältförsök anlades 2010 i befintliga odlingar av SW Joplin i Örebro län. Blad från plantans stjälk och kronblad samlades in var 5:e dag, med början den 21 juni, strax före blomning, och avslutades den 14 juli. Proverna förpackades och förvarades i frys. Sporfällan, Burkhard 7-day Spore trap, placerades i fält 25 maj - 1 augusti 2010 och 24 maj- 25 juli 2011, för att fånga in avgörande händelser. Tejpen byttes veckovis och klipptes i delar motsvarande dygnsfångster, innan de preparerades för molekylär diagnostik. Utvärdering av metoderna gjordes i tio fält 2011 då två provtagningar gjordes, den första i tidig blomning och den andra en vecka senare. Kronblad, de översta och lägst sittande bladen från tio plantor analyserades. I varje testyta togs jordprov för DNA- analys, och angreppet i beståndet bestämdes.
Slutsats och råd till näringen
Oljeväxtodlingen ökar, framförallt på gårdar där raps odlas regelbundet. Ökad frekvens av oljeväxter i växtföljden ökar risk för angrepp av bomullsmögel, en svamp som överlever med vilkroppar i jorden . Beslut om fungicidbehandling måste tas innan symtomen är synliga, och kräver att odlaren gör en aktiv riskbedömning.
Vi presenterar banbrytande verktyg för riskbedömning baserade på analys av svamp- DNA. Dessa metoder ger oss ny information om t ex svampar som tidigare inte kunde identifieras visuellt med mikroskop eller med agarplattor. Riskbedömning baserad på analys av svampens DNA på de lägst sittande bladen är ett effektivt verktyg för att lokalisera fältsmitta. Hur stort angreppet blir beror ytterst på väderleken, framförallt luftfuktigheten i beståndet, under blomningen. Analys av luftprover ger oss information som tydligt visar när sporspridningen startar på en bestämd lokal, och vi har sett att denna tidpunkt varierar mellan år. Sporfällor är ett effektivt verktyg som inte använts tidigare som vi anser har stor potential, och bör utvecklas vidare.
Vi har också visat att blommans kronblad, som tidigare varit huvudspåret när olika metoder testats, framstår som en osäker väg. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras. Fältbaserade tester har en stor potential, och fortsatt utveckling av nya s k isotermiska DNA-baserade metoder kan förenkla analysproceduren ytterligare. Utveckling av sporfällor och optimering av tekniken så att analyser dagligen kan sändas som textmeddelanden tillsammans med lokala väderprognoser kommer att vara hörnpelare i en aktiv prognosmodell.
Sammantaget ger våra nya resultat en stor affärsnytta för lantbrukaren, då en fältbaserad analys ger svar på om svampen finns i beståndet, och en behovsanpassad fungicidbehandling minskar avtrycken i miljön.

 

Antal träffar i projektbanken: 1722

Filtermaterialets påverkan på underhållsbehov, vattenkvalitet och skörd vid täckdikning
Eva Edin, Hushållningssällskapet HS Konsult AB

Projektnummer: JTI-21-83-606 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2021

The overall purpose of the project is to generate a base for recommendations for construction of new subsurface drainage and re-drainage of clay soils in the area Water - resource efficient management. Efficient drainage of arable land is important to increase crop production, to achieve …

Läs mer

FeNomen: Fertilitet hos nasjonale norske hesteraser.
Ingrid H Holmøy, Norwegian University of Life Sciences, Veterinary Faculty

Projektnummer: R-21-47-575 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2021

Decreasing population sizes and risk of accumulation of inbreeding is a challenge for the national Norwegian horse breeds; the Dole, the Fjord and the Nordland/Lyngen. The average breed-specific reduction in covered mares is between 37% and 45%, when comparing the years 2000 to 2009 to the years …

Läs mer

Växtnäringseffekt hos nya gödselprodukter - Metodutveckling för kvalitetssäkring
Åsa Myrbeck, RISE, Jordbruk och Livsmedel

Projektnummer: JTI-20-83-494 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

For sustainable future development, it is essential to recirculate plant nutrients from different parts of society,
especially sewage plants, back to arable land. The aim of the proposed project is to ensure that high-quality fertiliser
products attractive for agricultural use are produced from …

Läs mer

Nya rotsjukdomar i korn och vete- okända hot mot svensk spannmålsodling
Lars Persson

Projektnummer: O-20-20-472 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Crop production

Cereal production is limited by many different factors. Leaf diseases are often well known, while diseases on roots are more difficult to identify. Root diseases are often caused by oomycetes, fungus-like microorganisms that live for years in soil and on old root debris, parasitizing the roots of …

Läs mer

Strategier för välmående kor i lönsamma företag
Helena Hansson

Projektnummer: O-18-21-152 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2018

Mjölk

This project aims at investigating the relationship between animal health and fertility, productivity in terms of milk yield and the economic outcome of dairy farms, and to investigate the conditions under which farms can succeed in combining profitability with high animal health standards.
There …

Läs mer

Diagnos av parasitsjukdomar hos hästar med hjälp av mikrofluidik och mobiltelefonbaserad mikroskopi
Jonas Tegenfeldt, Lunds Universitet

Projektnummer: H-19-47-493 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

All horses grazing freely are at risk of parasitic diseases. Due to a growing problem with drug resistance in parasites, there is a need to improve the diagnostic methods. One important problem with today's situation is that one diagnostic procedure costs significantly more than one treatment, both …

Läs mer

Går det att höja vallskördarna med enstaka bevattningsgivor - vad händer med kvaliteten?
Ingrid Wesström

Projektnummer: O-19-20-316 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2019

Crop production
Milk

Climate change has brought about changing conditions for agriculture. In recent years precipitation deficit during the growing season has led to a shortage of forage in Sweden. During dry years, irrigation is necessary to achieve optimal yields. In addition, irrigation can bring about positive …

Läs mer

Förbättrad rengöring och desinfektion på köttanläggningar - minskad spridning av livsmedelsförstörande, patogena och antibiotikaresistenta bakterier
Sofia Boqvist

Projektnummer: O-20-20-447 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Poultry
Meat

Cleaning and disinfection are critical elements for meat premises when it comes to production of safe food of high quality. It is the responsibility of the meat premises to ensure this is done efficiently to keep levels of pathogenic, spoilage and antimicrobial resistant bacteria low. This can be …

Läs mer

Från hav till mule - alger minskar metanemissioner från mjölkkor
Rebecca Danielsson

Projektnummer: O-20-23-461 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Meat
Milk

The purpose of this project is to investigate to what extent substances in algae inhibit microbial methane formation in cows. Several substances, so-called bioactive substances, in red, green and brown algae, have a significant methane reducing effect. These are promising results but in order to …

Läs mer

Förbättrad utvärdering av officiella fältförsök genom bildanalys av drönarfoton med maskininlärning
Aakash Chawade

Projektnummer: O-20-23-462 • Status: Pågående • Ansökningsår: 2020

Crop production
Energy and biomass

The goal of the project is to digitize the data from the Swedish official field trials through automated estimates of important traits such as germination, growth, resistance, maturity and the effect of plant protection products. The purpose is to streamline and improve scoring of both diseases but …

Läs mer
Prenumerera på vårt nyhetsbrev