Stiftelsen lantbruksforskning

Lantbruks- och trädgårdsföretagarnas egen forskningsstiftelse finansierar behovsdriven forskning för svenska förhållanden.
Läs mer

Utveckling av beslutsstöd för riskbedömning av Sclerotinia sclerotiorum i vårraps genom kvantifiering av luftburen smitta och studier av infektionsprocessen

Status: Avslutat
Projektnummer: H0960195
Kategori: Research program | Field trial and method development
Ansökningsår: 2009
Datum för slutrapport: 3 november 2014
Huvudsökande: Ann-Charlotte Wallenhammar
Organisation: HS Konsult AB
E-postadress: ac.wallenhammar@hush.se
Telefon: 019 - 603 27 00
Beviljade medel: 740 000 SEK

Bomullsmögel som orsakas av Sclerotinia sclerotiorum, överlever med vilkroppar i jorden. S.sclerotiorum- DNA bestämdes med realtids PCR på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk i två fältförsök 2010. DNA påvisades på samtliga bladnivåer vid första provtagningen, och andel blad med DNA var statistiskt signifikant större för lägst sittande blad. Frånvaron av DNA på kronbladen i ett av försöken visar att den gängse uppfattningen om kronbladens betydelse för infektion måste omvärderas. Analyser av luftprover visade att sporspridningen avtagit innan blomningen. Test av verktygen i tio praktiska odlingar 2011 visade S.sclerotiorum DNA i samtliga fält, företrädesvis på lägst sittande blad vid andra provtagningen. Jordanalyserna, de första i sitt slag, visar förekomst i 55 % av fälten där odlingsuppehållet i de flesta fall överstiger tio år vilket är ett banbrytande upptäckt. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras.

Nya DNA-baserade verktyg banbrytande för riskbedömning av bomullsmögel i vårraps
Resultat
Svamp- DNA fanns på stjälkens blad vid första provtagningen i fältförsöken. Andelen blad med DNA ökade ju längre ner i beståndet bladen satt, och skillnaden mellan översta och lägst sittande blad var statistisk säkerställd. DNA påvisades inte på kronbladen vid någon av provtagningarna i ett av försöken, medan svampen samtidigt fanns på bladen. Analyserna av luftproven visar att sporspridningen hade upphört när blomningen började, och detta samband är banbrytande då infekterade kronblad tidigare ansetts vara källan till infektion. Test av verktygen i tio praktiska odlingar med stor variation i såtidpunkt visade att svamp- DNA fanns i samtliga fält, företrädesvis på lågt sittande blad vid andra provtagningen. Analyserna av luftproven 2011 visar att sporspridningen startade efter första provtagningen och sammanföll väl med andra provtagningen. Trots att odlingsuppehållet till föregående rapsgröda var mer än tio år, påvisade vi svamp- DNA på bladen i samtliga fält. Jordanalyserna, som är de första vi känner till, visade att spår av svampens vilkroppar fanns i 55 % av fälten.
Metod
Vi har bestämt svampens DNA med realtids-PCR teknik på kronblad och blad på olika nivåer av rapsplantans stjälk. Två fältförsök anlades 2010 i befintliga odlingar av SW Joplin i Örebro län. Blad från plantans stjälk och kronblad samlades in var 5:e dag, med början den 21 juni, strax före blomning, och avslutades den 14 juli. Proverna förpackades och förvarades i frys. Sporfällan, Burkhard 7-day Spore trap, placerades i fält 25 maj - 1 augusti 2010 och 24 maj- 25 juli 2011, för att fånga in avgörande händelser. Tejpen byttes veckovis och klipptes i delar motsvarande dygnsfångster, innan de preparerades för molekylär diagnostik. Utvärdering av metoderna gjordes i tio fält 2011 då två provtagningar gjordes, den första i tidig blomning och den andra en vecka senare. Kronblad, de översta och lägst sittande bladen från tio plantor analyserades. I varje testyta togs jordprov för DNA- analys, och angreppet i beståndet bestämdes.
Slutsats och råd till näringen
Oljeväxtodlingen ökar, framförallt på gårdar där raps odlas regelbundet. Ökad frekvens av oljeväxter i växtföljden ökar risk för angrepp av bomullsmögel, en svamp som överlever med vilkroppar i jorden . Beslut om fungicidbehandling måste tas innan symtomen är synliga, och kräver att odlaren gör en aktiv riskbedömning.
Vi presenterar banbrytande verktyg för riskbedömning baserade på analys av svamp- DNA. Dessa metoder ger oss ny information om t ex svampar som tidigare inte kunde identifieras visuellt med mikroskop eller med agarplattor. Riskbedömning baserad på analys av svampens DNA på de lägst sittande bladen är ett effektivt verktyg för att lokalisera fältsmitta. Hur stort angreppet blir beror ytterst på väderleken, framförallt luftfuktigheten i beståndet, under blomningen. Analys av luftprover ger oss information som tydligt visar när sporspridningen startar på en bestämd lokal, och vi har sett att denna tidpunkt varierar mellan år. Sporfällor är ett effektivt verktyg som inte använts tidigare som vi anser har stor potential, och bör utvecklas vidare.
Vi har också visat att blommans kronblad, som tidigare varit huvudspåret när olika metoder testats, framstår som en osäker väg. Riskvärdering baserad på DNA-analys av lägst sittande blad och fältets odlingshistorik presenteras. Fältbaserade tester har en stor potential, och fortsatt utveckling av nya s k isotermiska DNA-baserade metoder kan förenkla analysproceduren ytterligare. Utveckling av sporfällor och optimering av tekniken så att analyser dagligen kan sändas som textmeddelanden tillsammans med lokala väderprognoser kommer att vara hörnpelare i en aktiv prognosmodell.
Sammantaget ger våra nya resultat en stor affärsnytta för lantbrukaren, då en fältbaserad analys ger svar på om svampen finns i beståndet, och en behovsanpassad fungicidbehandling minskar avtrycken i miljön.

 

Antal träffar i projektbanken: 1647

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-793 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 31 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-791 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 30 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-794 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 30 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-789 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 29 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-792 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 23 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Basfinansiering av den regionala fältförsöksverksamheten (Sverigeförsöken) 2018
Ola Hallin, Hushållningssällskapens Service AB

Projektnummer: S-17-60-788 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 23 januari 2019

A safe and well documented decision making is necessary to achieve the best economic and environmental performance for Swedish agriculture and farmers. In this work, experiments, research and development have an important function and the regional field trials is a very important part in this …

Läs mer

Kartläggning av prestationsegenskaper, genetisk variation och hälsa hos kallblodstravaren
Gabriella Lindgren, Sveriges Lantbruksuniversitet, SLU

Projektnummer: H-15-47-075 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 30 december 2018

This SLU - NMBU collaborative study seeks to improve the performance, health and welfare of the Norwegian/ Swedish Coldblooded trotter. Experts in Equine clinical veterinary medicine, performance evaluation and genetic testing will analyze the genome of this horse breed for: 1) race performance …

Läs mer

Genomisk selektion mot icke-koagulerande mjölk
Maria Glantz,

Projektnummer: O-15-20-274 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 13 december 2018

Mjölk

The ability of milk to coagulate is crucial for cheese production. We have previously shown that 31% of milk from SR cows has problem to coagulate: 13% is poorly coagulating and as much as 18% is non-coagulating, which are alarming high figures. The problem with non-coagulating milk at national …

Läs mer

Kamp mot tramp - funkar bra i början men hur länge?
Eva Salomon,

Projektnummer: O-15-20-321 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 13 december 2018

Mjölk
Växtodling

Grazing systems for dairy cattle has the potential to be resource efficient for the farmer. However, increasing herd size can cause increasing problems with trampling damages on soil leading to claw problems and dirty udder, which costs working time for cleaning and risk of deteriorated animal …

Läs mer

Digitalt hjälpmedel för att identifiera och lokalisera bladmögel i ekologisk potatisodling
Lisa Germundsson, Sveriges Lantbruksuniversitet

Projektnummer: R-17-20-002 • Status: Avslutat • Datum för slutrapport: 22 november 2018

One of the most difficult disease problems to handle in organic farming is potato late blight. Late blight is a very aggressive disease and an established infestation can result in interrupted cultivation. This means greatly reduced or even completely lost harvest. Because chemical control is not …

Läs mer

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Namn
E-postadress